Bioeconomia: Diversidade e Riqueza para o Desenvolvimento Sustentável
22 a 24 de outubro de 2019
Trabalho 12803
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Genética e melhoramento vegetal |
| Setor | Instituto de Ciências Agrárias |
| Bolsa | PIBIC/CNPq |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | CNPq |
| Primeiro autor | Raquel Aime Louroza Ribeiro |
| Orientador | PEDRO IVO VIEIRA GOOD GOD |
| Outros membros | Mayumi Furuya de Assis |
| Título | Caracterização dos locos Rhg1 e Rhg4 de resistência ao nematoide do cisto em cultivares de soja |
| Resumo | Um dos desafios para o melhoramento da soja é incorporar resistência genética eficiente ao nematoide de cisto da soja (NCS) (Heterodera glycines). Os locos Rhg1 e Rhg4 são relatados como QTL (Quantitative Trait Loci) mais influentes na determinação da resistência ao NCS. O loco Rhg1 consiste de um cluster de genes (AAT, α-SNAP e WI12) que possui variação em relação ao número de cópias, bem como diferentes subtipos de sequências. O loco Rhg4 codifica um gene específico de resistência (SHMT) e atua de forma coordenada com o número de cópias de Rhg1. Portanto, os fatores que interferem na resistência ao NCS estão associados à variação do número de cópias dos genes Rhg1 e presença ou ausência de Rhg4. Para a identificação desses locos e, outros QTLs, podem ser utilizados marcadores microssatélites (SSR), via Reação de Polimerização em Cadeia (PCR). O objetivo deste trabalho foi otimizar as condições de reação PCR para a detecção de marcadores SSR associados a QTL de resistência a NCS. Foram realizados ensaios fatoriais para testar: (1) concentração de MgCl2; (2) Temperatura de anelamento de primers; (3) número de ciclos PCR; (4) concentração de DNA e (5) qualidade do DNA na relação A260/A280. Os resultados foram avaliados por meio da integridade e intensidade dos produtos de amplificação de DNA, bem como a sua repetibilidade, com base na visualização de bandas em gel de eletroforese. Verificou-se que é fundamental realizar testes de gradiente de temperatura de anelamento para diferentes pares de primers SSR. As temperaturas médias de anelamento entre 55 e 57 °C produziram os melhores resultados, entretanto, deve-se utilizar temperaturas específicas para cada par de primers. DNA mais íntegro (relação A260/A280 > 1,5) e na concentração de 30 ng por reação possibilitou obter bandas mais intensas. O aumento do número de ciclos não foi eficiente para o aumento da intensidade de bandas. A concentração de MgCl2 de 2,5 mM foi a que apresentou os melhores resultados. A repetibilidade dos processos de amplificação e qualidade foi baixa, o que demanda novos testes. Novas combinações de fatores devem ser testadas para que a qualidade e repetibilidade desejadas sejam alcançadas. |
| Palavras-chave | Microssatélite, PCR, Otimização. Repetibilidade |
| Forma de apresentação..... | Oral |