"Ciências Básicas para o Desenvolvimento Sustentável"
24 a 26 de outubro de 2023
Trabalho 19880
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Agronomia |
| Setor | Departamento de Fitopatologia |
| Bolsa | PIBIC/CNPq |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Apoio financeiro | CNPq |
| Primeiro autor | Josué Euclides Silva Teixeira |
| Orientador | RAFAEL FERREIRA ALFENAS |
| Outros membros | Márcia Ferreira Queiroz |
| Título | Desenvolvimento de marcadores moleculares SSR para estudos de diversidade de //Calonectria pteridis// |
| Resumo | A mancha de calonectria causada por Calonectria pteridis, é uma das principais doenças na cultura do Eucalyptus spp. As plantas infectadas pelo patógeno apresentam pequenas manchas, circulares ou alongadas e de coloração cinza-claro a marrom-clara que progridem atingindo grande área do limbo foliar, ocasionando a perda da área fotossintética, desfolha. principalmente em genótipos suscetíveis. O plantio de genótipos resistentes ainda é a melhor estratégia de controle da doença, o que remete ao conhecimento da estrutura do genoma, para predizer a estabilidade da resistência. Assim, o objetivo deste estudo é desenvolver marcadores microssatélites (SSR) a partir de dados genômicos em C. pteridis. O genoma do isolado LPF059 de C. pteridis foi sequenciado pela plataforma Illumina NovaSeq6000. O genoma montado e anotado foi utilizado para identificar regiões de SSR, através do software MISA. O proteoma predito do isolado foi submetido à identificação de proteínas potencialmente envolvidas no metabolismo de carboidratos usando o servidor dbCAN2 e para predição de proteínas secretadas, a presença de peptídeo sinal na sequência proteína foi identificada usando o SignalP v. 4.1 (cutoff = 0,45). Para seleção de marcadores SSR duas abordagens foram empregadas (i) 104 marcadores gênicos SSR baseados em análise de bioinformática para identificação de proteínas secretadas, CAZymes e proteínas putativamente associadas à patogenicidade e (ii) 46 marcadores genômicos-SSR selecionados aleatoriamente com sequências repetitivas ≥ 24 bases. Para validação, os primers SSR que não amplificaram foram descartados. Amostras de DNA de nove isolados de C. pteridis (LPF059, LPF201, LPF294, LPF315, LPF338, LPF344, LPF436, LPF457, LPF2315) foram selecionadas para amplificação por PCR usando os primers SSR. Um total de 4.660 SSRs com motivos de repetição perfeitos foram identificados a partir da sequência genômica montada do isolado LPF059 de C. pteridis. Dos SSRs totais, os nucleotídeos foram o tipo mais frequente de repetições, representando 66,03%, seguidos por tri- 27,98%, tetra- 3,02%, penta- 1,78% e hexanucleotídeos 1,18%. Os padrões de SSR também foram avaliados quanto ao número de unidades repetitivas, variando de 5 a 27 unidades. Os números de repetições mais frequentes foram penta- e hexanucleotídeos, para todos os tipos de padrões, com maiores proporções de exonic SRRs nos padrões di-, tri- e hexanucleotídeos e intronic SSRs nos padrões do tipo tetra e pentanucleotídeos. Este trabalho fornece uma base para estudos futuros em função e expressão gênica, podendo levar a um melhor entendimento da biologia, adaptabilidade e patogênese de C. pteridis e, contribuir para o desenvolvimento de estratégias de manejo inovadoras e eficazes em plantios comerciais de eucalipto. |
| Palavras-chave | mancha-de-pteridis, microssatélites, genoma |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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