"Ciências Básicas para o Desenvolvimento Sustentável"

24 a 26 de outubro de 2023

Trabalho 19688

ISSN 2237-9045
Instituição Universidade Federal de Viçosa
Nível Graduação
Modalidade Pesquisa
Área de conhecimento Ciências Biológicas e da Saúde
Área temática Biologia geral
Setor Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular
Bolsa Não se Aplica
Conclusão de bolsa Não
Primeiro autor Lays Martins Coelho
Orientador KARINE FREHNER KAVALCO
Outros membros Fabiano Bezerra Menegídio, Iuri Batista da Silva, RUBENS PASA
Título Filogenia do gênero Eupsittula (Psittacidae: Arinae)
Resumo A família Psittacidae, pertencente à ordem Psittaciformes, é um grupo de aves de ampla distribuição nas regiões tropicais da África e América, com ocorrências também na Patagônia Andina. Os psitacídeos neotropicais, agrupados na subfamília Arinae, representam o maior grupo dentro da ordem. Eupsittula é composto por cinco espécies, três de ocorrência no Brasil. Apesar da diversidade de coloração da plumagem de psitacídeos, alguns grupos são bastante homogêneos, gerando controvérsias taxonômicas. Pela falta de estudos moleculares, há divergências quanto às relações filogenéticas em Arinae. Após revisão relativamente recente do gênero Aratinga, espécies foram reagrupadas e cinco formaram o gênero Eupsittula. O estudo de genomas mitocondriais é uma relevante estratégia para melhor conhecimento das espécies. Fornece informações de diversidade genética, taxonomia e relações filogenéticas dos grupos, o que consequentemente contribui para o melhor entendimento de suas histórias evolutivas. Sendo assim, nosso objetivo foi inferir a relação filogenética do gênero Eupsittula utilizando genomas mitocondriais completos. Pesquisamos no repositório público Sequence Read Archive (SRA) do National Center for Biotechnology Information (NCBI), bibliotecas de DNA-seq das espécies de Eupsittula, e também de Aratinga e Psittacara enquanto grupo externo. As bibliotecas foram importadas para a plataforma Galaxy Europe e utilizadas na ferramenta NOVOplasty v.4.3.1, onde obtivemos os mitogenomas completos circularizados. Utilizamos sequências ND2 como seed e k-mer de 39. As sequências circularizadas foram anotadas no MITOS2 v.2.1.3, na mesma plataforma. As sequências dos genes codificadores de proteína (PCG) foram separadas manualmente em arquivos individuais para cada PCG e alinhadas no software MEGA 11. Os alinhamentos foram concatenados e particionados na ferramenta Concatenator v.0.2.1. A inferência filogenética foi realizada utilizando o IQ-TREE. Utilizamos o modelo de substituição "Auto" e bootstrap “Ultrafast” com 1.000 réplicas, pelo método de Máxima Verossimilhança. A árvore foi enraizada e organizada por meio da ferramenta online ITOL v.6. Foram montados quatro mitogenomas de Eupsittula, um de Psittacara e um de Aratinga. Eles variaram em tamanho de 16.968 a 16.984 pb, com porcentagens de GC variando de 46% a 47%. Foram identificados 13 genes codificadores de proteínas (PCGs), 2 rRNA e 22 tRNA. Tal padrão é o que comumente é identificado na família Psittacidae. Concluímos que o gênero Eupsittula é monofilético e que E. pertinax e E. cactorum são os táxons mais basais, consistente com o descrito na literatura. Em discordância, foi observada aqui relações distintas do já descrito, como E. nana agrupada próxima de E. canicularis, e não de E. aurea. A inferência filogenética de Eupsittula, contribui para a elucidação de controvérsias e dúvidas quanto à taxonomia e relações filogenéticas dentro da família Psittacidae.
Palavras-chave Mitogenoma, Psittaciformes, Relações filogenéticas
Forma de apresentação..... Vídeo
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