Resumo |
A epistasia é um processo genético no qual um gene influencia outro gene, tendo um efeito na avaliação da heterose e capacidade de combinação em populações. A influência da epistasia é especialmente relevante quando há desequilíbrio de ligação (LD), e as interações aditiva x aditiva e dominância x dominância são as principais formas de epistasia que afetam a heterose e capacidade de combinação. Neste estudo, a epistasia foi avaliada nas análises de heterose e capacidade de combinação usando um modelo aditivo com centenas de genes, LD, dominância e sete tipos de epistasia digênica. Uma teoria de genética quantitativa foi desenvolvida para simular os valores genotípicos individuais em nove populações, incluindo populações autofecundadas, 36 cruzamentos entre populações, 180 haploides duplos (DHs) e seus 16.110 cruzamentos, assumindo 400 genes em 10 cromossomos de 200 cM. O conjunto de dados simulado foi gerado usando o REALbreeding, por meio das etapas de simulação do genoma, simulação da população e simulação do traço, onde são especificados o número de cromossomos, marcadores moleculares, genes, tamanho da amostra ou progênie, frequência média de genes e marcadores, valores genotípicos e fenotípicos mínimos e máximos, direção e grau de dominância, e herdabilidade em sentido amplo. A epistasia pode prejudicar a análise de heterose e capacidade de combinação em populações, mas isso varia de acordo com o tipo de epistasia, porcentagem de genes epistáticos e magnitude de seus efeitos. No entanto, genes duplicados com efeitos cumulativos e interação gênica não-epistática não mostraram uma diminuição na heterose média com o aumento desses fatores. Os mesmos resultados são observados na análise da capacidade de combinação de DHs. A epistasia não afetou a identificação dos DHs mais divergentes nas análises de capacidade de combinação de subconjuntos de 20 DHs, independentemente do número e magnitude dos efeitos dos genes epistáticos. No entanto, a avaliação de DHs superiores pode ser prejudicada se todos os genes forem epistáticos, dependendo do tipo e magnitude do efeito epistático. |