"Ciências Básicas para o Desenvolvimento Sustentável"
24 a 26 de outubro de 2023
Trabalho 19169
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Microbiologia |
| Setor | Departamento de Microbiologia |
| Bolsa | PET |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Apoio financeiro | Outros |
| Primeiro autor | Suelen Chaves Fernandes |
| Orientador | MATEUS FERREIRA SANTANA |
| Outros membros | Luiza Maria Oliveira de Lima |
| Título | Identificação in silico de Elementos Integrativos e Conjugativos (ICEs) em bactérias do gênero Azotobacter |
| Resumo | O gênero Azotobacter representa o principal grupo de bactérias heterotróficas de vida livre fixadoras de nitrogênio. Elas constituem um grupo muito estudado por apresentarem substâncias promotoras de crescimento em plantas, ressaltando a importância do gênero na ecologia e agricultura. Os ICEs são elementos genéticos móveis auto-transmissíveis que podem carregar genes associados à expressão fenotípica na bactéria hospedeira, que resultam em vantagens adaptativas. Com o objetivo de investigar uma possível relação entre ICEs e a capacidade de promover crescimento de plantas, 43 genomas do gênero Azotobacter foram baixados e investigados in silico quanto a presença desses elementos. Após o download do genoma completo das espécies no banco de dados NCBI (National Center for Biotechnology Information), foram utilizados softwares especializados na identificação de ICEs. A sequência de trabalho utilizada se iniciou com software ICEfinder que prevê sequências assinatura de ICE, tais como genes integrase, T4SS e a sequência oriT. O oriTfinder foi usado para detectar sequências de origem de transferência conjugativa que são necessárias para mobilização dos ICEs. O ICEberg foi usado para determinar a presença no genoma de sequências similares a ICEs já descritas. Por fim, o antiSMASH foi utilizado para identificar genes cargos relacionados a metabólitos secundários. Foram identificados 47 prováveis ICES dentre as regiões dos 43 genomas de Azotobacter analisados, com tamanhos de sequência que variam entre 20.417 a 403.713 pb. A região oriT foi encontrada em apenas 3 isolados, sendo todos com tamanho de 90 pares de base. Em 35 isolados foram encontradas relaxases com tamanho que varia entre 867aa até 481aa, sendo esta a enzima responsável por cortar a fita de DNA a ser transferida. Todos os isolados apresentam T4CP, mas apenas 29 deles possuem Sistema de Secreção IV (T4SS), maquinaria responsável pela conjugação dos elementos. Apenas na espécie A. vinelandii foi detectada presença de ICE já identificada, o que abre a possibilidade da descoberta de elementos inéditos nas outras espécies do gênero. Em relação aos metabólitos secundários, foram encontrados Non-ribosomal peptide synthetases (NRPSs), que são compostos estruturalmente e funcionalmente diversos, que permitem que as bactérias hospedeiras expandam suas capacidades metabólicas. Portanto, os ICEs podem ter um importante papel na adaptação da espécie a diferentes ambientes ou mesmo estar relacionado a produção de compostos que estimulam a promoção do crescimento vegetal. Futuros estudos serão realizados in vivo para demonstrar o possível impacto de ICEs em Azotobacter na promoção de crescimento de plantas. |
| Palavras-chave | Bioinformática, Elementos genéticos móveis, Elementos Integrativos e Conjugativos |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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