"Ciências Básicas para o Desenvolvimento Sustentável"
24 a 26 de outubro de 2023
Trabalho 18905
| ISSN | 2237-9045 |
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| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Ensino médio |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Genética |
| Setor | Departamento de Microbiologia |
| Bolsa | BIC-Júnior |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Primeiro autor | Simone Celso de Oliveira |
| Orientador | MATEUS FERREIRA SANTANA |
| Outros membros | Luiza Maria Oliveira de Lima |
| Título | Identificação in silico de Elementos Integrativos e Conjugativos (ICEs) na bactéria Bacillus amyloliquefaciens, espécie envolvida no controle biológico |
| Resumo | Os elementos integrativos e conjugativos (ICEs) são elementos genéticos móveis (EGMs) que normalmente são encontrados no cromossomo de bactérias. Os ICEs, além dos genes relacionados à conjugação, podem conter genes acessórios. Existem poucos trabalhos que incluem a identificação e caracterização de ICEs em bactérias não-patogênicas. Neste trabalho, analisamos o isolado ASM1939692v1 da bactéria Bacillus amyloliquefaciens, uma bactéria Gram-positiva conhecida por seu emprego benéfico na agricultura como agente de controle biológico. O isolado foi analisado quanto a presença de ICEs com o objetivo de investigar se esse EGM poderia estar envolvido em mecanismos de interação planta-microrganismo, sendo um possível potencializador de características de interesse agronômico. Para isso, o genoma da espécie tipo Bacillus amyloliquefaciens foi baixado do banco de dados do NCBI (National Center for Biotechnology Information) e as análises do genoma foram realizadas nos softwares ICEfinder, OriTfinder e antiSMASH. Nossos resultados indicaram a presença de uma possível ICE, de tamanho 264492 pb, com 42.72% de conteúdo GC e contendo sequências relacionadas a proteínas relaxase, enzimas essenciais para a transferência de DNA durante o processo de conjugação bacteriana, de 410 aminoácidos. A presença de uma região oriT, de tamanho 410 bp localizada na região 4060161..4060371(+), é um forte indicativo da presença de ICE no genoma do isolado, visto que a presença de uma relaxase e de uma região oriT sugere que há um mecanismo de transferência de DNA ativo na bactéria. Não foram encontrados indícios que indiquem a presença do sistema T4SS (Sistemas de Secreção Tipo IV), responsável pela montagem e funcionamento dos complexos de secreção envolvidos na conjugação bacteriana, ou da proteína T4CP, uma proteína componente da maquinaria de T4SS e essencial para seu funcionamento. No entanto, a ausência de T4SS e T4CP não descarta a possível presença de uma ICE. Em relação aos metabólitos secundários, dentre os encontrados, os principais foram as enzimas Non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) que catalisam a síntese de produtos peptídicos importantes a partir de uma variedade de substratos de aminoácidos padrão e não proteinogênicos e os inibidores de proteassoma e agentes bacterianos Beta-lactone containing protease inhibitor (betalactone). Análises mais aprofundadas e específicas para confirmar a presença da ICE na bactéria e caracterizar seus componentes e características específicas serão realizadas em outra etapa da pesquisa. Essa pesquisa foi desenvolvida com o apoio da instituição de fomento FAPEMIG em detrimento do edital BIC-JÚNIOR/UFV/FAPEMIG/ 2022-2023. |
| Palavras-chave | Elementos integrativos e conjugativos, Elementos genéticos móveis, Bioinformática |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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