"Ciências Básicas para o Desenvolvimento Sustentável"
24 a 26 de outubro de 2023
Trabalho 18583
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Genética |
| Setor | Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde - Campus Rio Paranaíba |
| Bolsa | PIBIC/CNPq |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | CNPq |
| Primeiro autor | Samyra Stéphane Neves Pereira |
| Orientador | KARINE FREHNER KAVALCO |
| Outros membros | Maria Luiza dos Santos Leocádio, RUBENS PASA |
| Título | Monitoramento de variantes genéticas do vírus SARS-CoV-2 circulantes na região do Alto Paranaíba |
| Resumo | A pandemia de COVID-19 assolou o mundo por 3 anos e foi uma das maiores crises de saúde pública já enfrentada. O vírus causador da doença, o SARS-CoV-2, provoca uma ampla gama de sintomas, desde casos assintomáticos até quadros clínicos graves e fatais, e sofre mutações rapidamente, prejudicando a resposta imunológica e o desenvolvimento de vacinas. Dentre suas variantes, se destacam as VOCs (variantes preocupantes), caracterizadas por maior transmissibilidade, gravidade e capacidade de evadir diagnósticos, tratamentos e vacinas existentes. Algumas VOCs foram detectadas no Brasil, como a P1 (GAMA), B.1.617 (DELTA) e a B.1.1.529 (ÔMICRON). O monitoramento de VOCs para fins epidemiológicos se tornou necessário, sendo realizado por meio do sequenciamento completo do genoma viral ou pelo sequenciamento simplificado de uma região específica do gene S. No Laboratório de Diagnósticos Moleculares (LDM) da Universidade Federal de Viçosa, campus de Rio Paranaíba, iniciou um projeto visando caracterizar as variantes do SARS-CoV-2 na região do Alto Paranaíba. O LDM foi estabelecido em maio de 2020 para auxiliar no diagnóstico de casos de COVID-19 em Minas Gerais, atendendo principalmente os municípios da Superintendência Regional de Saúde de Patos de Minas (SRS Patos de Minas). Ao decorrer da pandemia, as VOCs passaram a ser cada vez mais detectadas nas amostras sequenciadas no Brasil, entretanto, os recursos limitados para o monitoramento eram frequentemente concentrados nas capitais e regiões metropolitanas, deixando lacunas no monitoramento local e no controle efetivo da pandemia. Com base nisso, o objetivo deste trabalho foi identificar a diversidade genômica de vírus SARS-CoV-2 circulantes na região de abrangência da SRS Patos de Minas. Para o estudo, foram selecionadas amostras previamente diagnosticadas como positivas para o vírus pelo LDM e armazenadas anonimamente, com CT médio dos genes virais inferior a 30. Essas amostras, representativas do conjunto amostral, foram submetidas à extração automatizada do material genético e à amplificação por meio de reação de PCR convencional, primers específicos para a amplificação do gene S e kit para PCRs. Após a PCR, o produto passou por checagem de amplificação via gel de agarose a 2% e foi preparado e enviado a serviço terceirizado de sequenciamento “Sanger”. Embora em gel a checagem de amplificação tenha se mostrado positiva, duas tentativas de sequenciamento foram feitas, mas não obtivemos sucesso. Após isso, houve insucesso nas amplificações por problemas de causa não identificada, apesar dos esforços e vários testes realizados. Por isso, nossas análises não prosseguiram para o sequenciamento. Além disso, houve uma redução drástica no número de amostras recebidas e analisadas pelo laboratório, conforme se deu o avanço da vacinação, bem como o aumento do uso de testes de antígenos, impactando negativamente o projeto, limitando o conjunto de amostras disponíveis para estudo. |
| Palavras-chave | Sequenciamento, COVID-19, vírus. |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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