Resumo |
Os programas de melhoramento de batata-doce (Ipomoea batatas) exigem um longo período para lançamento de novas variedades. A utilização de marcadores moleculares de DNA para seleção assistida e seleção genômica podem auxiliar na redução desse tempo e no consequente aumento de ganhos genéticos. Quando a seleção é feita sem conhecimento direto dos fenótipos, o controle de qualidade dos experimentos deve ser rigoroso, já que a existência de erros de identificação pode impedir o progresso da seleção. Este trabalho teve como objetivo avaliar o uso de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em clones de batata-doce de dois programas de melhoramento em Uganda para fins de controle de qualidade. Para tanto, dosagem hexaploide (ou contagem do alelo alternativo de 0 a 6) dos marcadores foi realizada com base nas intensidades dos alelos geradas pela tecnologia kompetitive allele specific PCR (KASP). Na primeira etapa (validação), 60 marcadores foram testados utilizando 94 amostras de DNA de um dialelo parcial do Centro Internacional de Batata (CIP), Uganda. Dos 60 marcadores, 4 não amplificaram, 22 foram monomórficos, e 34 foram polimórficos após estimação de dosagem alélica. Na segunda etapa (aplicação), 30 desses marcadores polimórficos foram utilizados nas amostras de DNA de clones dos programas de CIP-Uganda (260 amostras) e NaCRRI (90 amostras) originados de casa-de-vegetação e campo. Para cada SNP, os indivíduos de origens diferentes localizados na mesma região do gráfico de dispersão foram classificados como coincidentes. Foram considerados amostras de DNA pertencentes ao mesmo clone quando mais de 50% de SNPs coincidiram. Um total de 48 (18,5%) e 32 (35,6%) indivíduos das respectivas populações CIP-Uganda e NaCRRI no campo não correspondiam às amostras com mesmo nome na casa-de-vegetação. Os marcadores foram úteis para fins de controle de qualidade, muito embora apenas uma análise visual de gráficos de dispersão tenha possibilitado utilizar a informação dos marcadores para identificar as coincidências. A aplicação desses marcadores possibilitará o acompanhamento das taxas de erros de etiquetagem e, consequentemente, tem o potencial de aumentar ganhos genéticos em programas de melhoramento da cultura ao garantir a identidade dos clones selecionados. |