"Ciências Básicas para o Desenvolvimento Sustentável"

24 a 26 de outubro de 2023

Trabalho 18400

ISSN 2237-9045
Instituição Universidade Federal de Viçosa
Nível Graduação
Modalidade Pesquisa
Área de conhecimento Ciências Agrárias
Área temática Agronomia
Setor Departamento de Agronomia
Bolsa CNPq
Conclusão de bolsa Não
Apoio financeiro CNPq
Primeiro autor Thiago Cruz Pimentel
Orientador GUILHERME DA SILVA PEREIRA
Título Validação de marcadores moleculares SNP para uso em controle de qualidade em programas de melhoramento genético de batata-doce
Resumo Os programas de melhoramento de batata-doce (Ipomoea batatas) exigem um longo período para lançamento de novas variedades. A utilização de marcadores moleculares de DNA para seleção assistida e seleção genômica podem auxiliar na redução desse tempo e no consequente aumento de ganhos genéticos. Quando a seleção é feita sem conhecimento direto dos fenótipos, o controle de qualidade dos experimentos deve ser rigoroso, já que a existência de erros de identificação pode impedir o progresso da seleção. Este trabalho teve como objetivo avaliar o uso de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em clones de batata-doce de dois programas de melhoramento em Uganda para fins de controle de qualidade. Para tanto, dosagem hexaploide (ou contagem do alelo alternativo de 0 a 6) dos marcadores foi realizada com base nas intensidades dos alelos geradas pela tecnologia kompetitive allele specific PCR (KASP). Na primeira etapa (validação), 60 marcadores foram testados utilizando 94 amostras de DNA de um dialelo parcial do Centro Internacional de Batata (CIP), Uganda. Dos 60 marcadores, 4 não amplificaram, 22 foram monomórficos, e 34 foram polimórficos após estimação de dosagem alélica. Na segunda etapa (aplicação), 30 desses marcadores polimórficos foram utilizados nas amostras de DNA de clones dos programas de CIP-Uganda (260 amostras) e NaCRRI (90 amostras) originados de casa-de-vegetação e campo. Para cada SNP, os indivíduos de origens diferentes localizados na mesma região do gráfico de dispersão foram classificados como coincidentes. Foram considerados amostras de DNA pertencentes ao mesmo clone quando mais de 50% de SNPs coincidiram. Um total de 48 (18,5%) e 32 (35,6%) indivíduos das respectivas populações CIP-Uganda e NaCRRI no campo não correspondiam às amostras com mesmo nome na casa-de-vegetação. Os marcadores foram úteis para fins de controle de qualidade, muito embora apenas uma análise visual de gráficos de dispersão tenha possibilitado utilizar a informação dos marcadores para identificar as coincidências. A aplicação desses marcadores possibilitará o acompanhamento das taxas de erros de etiquetagem e, consequentemente, tem o potencial de aumentar ganhos genéticos em programas de melhoramento da cultura ao garantir a identidade dos clones selecionados.
Palavras-chave Ipomoea batatas, Dosagem alélica, Gráfico de dispersão.
Forma de apresentação..... Vídeo
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