“Inteligência Artificial: A Nova Fronteira da Ciência Brasileira”
19 a 24 de outubro de 2020
Trabalho 14286
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Bioquímica |
| Setor | Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Primeiro autor | Júlia Mayrink Ferreira |
| Orientador | GUSTAVO COSTA BRESSAN |
| Outros membros | EVERTON DE ALMEIDA ALVES BARBOSA, Marcelo Depólo Polêto |
| Título | Parametrização de inibidores de SRPKs: subsídios para o desenvolvimento de agentes antimetastáticos |
| Resumo | O processo de splicing é finamente controlado por uma série de mecanismos celulares. Serine/arginine-rich proteins kinases (SRPK) são enzimas envolvidas na fosfo-regulação de fatores que auxiliam na regulação do splicing de pré-mRNAs. A atividade intensificada e anormal de cinases dessa família, especialmente SRPK1 e SRPK2, tem sido verificada em uma série de patologias humanas, como infecções virais e diversos tipos de câncer, o que aponta para o potencial terapêutico das SRPKs no combate a essas doenças. De fato, a determinação da ação inibitória do ligante SRPIN340 na atividade de SRPK1 e SRPK2 abriu caminho para a investigação de moléculas análogas ao SRPIN340 com o intuito de se obter uma maior seletividade e toxicidade para as células tumorais.Nesse contexto, o emprego de ferramentas de biofísica computacional pode guiar o desenvolvimento de novos fármacos, uma vez que permite o estudo de fenômenos biológicos, como a formação do complexo receptor-ligante, em nível atômico. Uma vez que a maioria desses fenômenos está associada à flexibilidade das biomoléculas, técnicas de simulação de dinâmica molecular permitem obter modelos muito mais próximos da realidade biológica. No entanto, para que a dinâmica seja corretamente descrita, é preciso que os parâmetros adequados (ligações, ângulos, torções, cargas parciais e potenciais de Lennard-Jones) estejam calibrados. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi obter os parâmetros de três inibidores das SRPK1 e SRPK2: SRPIN340, SPHINX31 E W4A. A metodologia empregada consistiu na geração de novos perfis torcionais a partir de métodos quânticos do tipo MP2/6-31G* para cada diedro não descrito no campo de força utilizando o software Gaussian09. Ainda, a construção das topologias dos ligantes seguiu protocolo já estabelecido e atenção especial foi dada na derivação de parâmetros torcionais para cada diedro, de modo que estes reproduzissem o perfil torcional obtido por métodos quânticos. Com a definição desses novos parâmetros, foi possível completar a topologia dos ligantes, etapa fundamental para a descrição correta da dinâmica molecular.Os próximos passos deste projeto incluem a simulação do complexo SRPK-ligante para os três ligantes estudados e também a simulação dos ligantes livres em solução com o intuito de obter as populações conformacionais destes em seus respectivos estados complexado e não-complexado. A compreensão desses fenômenos dará maior subsídio para o desenho racional de fármacos mais potentes contra as SRPKs. |
| Palavras-chave | Dinâmica molecular, SRPK, parametrização |
| Forma de apresentação..... | Vídeo |
| Link para apresentação | Vídeo |
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