“Inteligência Artificial: A Nova Fronteira da Ciência Brasileira”
19 a 24 de outubro de 2020
Trabalho 14230
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Genética |
| Setor | Departamento de Fitopatologia |
| Bolsa | PIBIC/CNPq |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | CNPq |
| Primeiro autor | Phedra Gusmão da Silva de Oliveira |
| Orientador | FRANCISCO MURILO ZERBINI JUNIOR |
| Outros membros | João Paulo da Silva |
| Título | DIVERSIDADE E VARIABILIDADE DE BEGOMOVÍRUS EM Sida acuta |
| Resumo | Os begomovírus, pertencentes a família Geminiviridae, são vírus que infectam plantas e são transmitidos por insetos do complexo de espécies Bemisia tabaci, conhecida como mosca-branca. Possuem grande relevância na agricultura, por causarem doenças graves em várias culturas de interesse econômico. Possuem um capsídeo icosaédrico geminado constituído por uma única proteína estrutural, um genoma de DNA circular de fita simples, e podem ser divididos em dois grupos: Velho Mundo (VM) e Novo Mundo (NM). Os begomovírus do VM são caracterizados por apresentar, majoritariamente, genoma monossegmentado (um componente de DNA), e podem se associar a DNAs satélites. Já os begomovírus do NM possuem genoma bissegmentado, com dois componentes denominados DNA-A (que contém os genes que codificam proteínas associadas a replicação e encapsidação) e DNA-B (com genes responsáveis pelo movimento intra- e intercelular). Plantas não-cultivadas são reconhecidas como reservatórios de biodiversidade viral, e contribuem como fonte de inóculo para hospedeiros cultivados. O objetivo desse estudo foi avaliar a diversidade e a variabilidade genética de begomovírus associados a Sida acuta, de modo exploratório, em uma pequena extensão de área pouco antropizada. Plantas apresentando sintomas típicos de infecção por begomovírus foram coletadas no município de Viçosa-MG. Extraiu-se o DNA, e o genoma viral foi amplificado por meio de amplificação por círculo rolante, utilizando-se a enzima DNA polimerase do fago phi29. Os amplicons foram clivados com enzimas de restrição para obter-se fragmentos de aproximadamente 2600 nucleotídeos, correspondentes a um componente gênico, que foram clonados em E. coli para sequenciamento. As sequências obtidas foram submetidas a uma análise inicial com o algoritmo BLASTn pra identificação taxonômica. Em seguida foram gerados alinhamentos múltiplos de sequência utilizando o algoritmo MUSCLE implementado no programa MEGA X, e análises filogenéticas utilizando-se o programa MrBayes. No total foram geradas 36 sequências correspondentes ao DNA-A de Sida yellow leaf curl virus (SiYLCV). As arvores filogenéticas indicaram a presença de três grupos bem definidos, correspondendo a três variantes denominadas SiYLCV-I, -II e -III. A variante I foi a predominante em frequência, seguida da variante II e III. Os descritores de variabilidade, calculados com o programa DnaSP, indicaram que a população de SiYLCV apresenta baixa variabilidade genética. Análise de recombinação com o programa RDP não identificou nenhum evento de recombinação entre as variantes da SiYLCV. As análises de seleção realizadas no servidor DataMonkey indicaram que todos os genes do SiYLCV estão sob seleção negativa (purificadora). Nossos resultados reforçam observações de estudos anteriores nos quais foi constatado que as populações de vírus em Sida acuta coexistem como complexos constituídos por variantes distintas. |
| Palavras-chave | begomovírus, Sida acuta, geminiviridae |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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