“Inteligência Artificial: A Nova Fronteira da Ciência Brasileira”

19 a 24 de outubro de 2020

Trabalho 13567

ISSN 2237-9045
Instituição Universidade Federal de Viçosa
Nível Graduação
Modalidade Pesquisa
Área de conhecimento Ciências Biológicas e da Saúde
Área temática Bioquímica
Setor Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular
Bolsa PET
Conclusão de bolsa Não
Primeiro autor Débora Cristina Pimentel
Orientador RAPHAEL DE SOUZA VASCONCELLOS
Outros membros JULIANA LOPES RANGEL FIETTO, Leilane Ferreira Teixeira , Marcel Arruda Diogo, Marcelo Depólo Polêto
Título Avaliação in sílico da ligação de inibidores de cinases à SRPK de Leishmania braziliensis
Resumo Por ser a terceira causa mais comum de morbidade no mundo dentre as doenças parasitárias, a leishmaniose é categorizada pela Organização Mundial da Saúde (OMS) como uma das doenças tropicais negligenciadas endêmica em 98 países. Na América, o Brasil se encontra entre os primeiros países com maiores índices, reportando casos de Leishmaniose Tegumentar Americana (causada pela Leishmania braziliensis e Leishmania amazonensis) e Leishmaniose Visceral (causada pela Leishmania infantum). Os casos majoritários constituem a Leishmaniose Tegumentar Americana provocada principalmente pela L. braziliensis, cujos sinais clínicos se desenvolvem em úlceras localizadas no corpo e não apresentam tratamento eficaz por uma série de desafios, como a alta resistência do parasito aos medicamentos, efeitos colaterais e administração dificultada por via parenteral. Por esta razão, se faz necessário o estudo de novos alvos e compostos inibidores de interesse farmacológico que complementem o tratamento de modo mais eficaz. Uma classe de proteínas estudadas como alvo para tratamento de outras síndromes humanas são as Serine-arginine Protein Kinases (SRPK) que são cinases relacionadas à regulação do processo de splicing em mamíferos e pouco conhecidas em tripanossomatídeos, sendo relatado a primeira SRPK em Trypanosoma cruzi em 2003 por Portal e colaboradores. Em contrapartida, compostos análogos ao inibidor específico de SRPKs humanas (SRPIN340) são estudados para inibição dessa enzima em L. braziliensis (LbSRPK). Dados não publicados do nosso grupo de pesquisa sugerem atividade leishmanicida in vitro por dois análogos do SRPIN340. Sendo assim, esse trabalho tem por objetivo realizar a modelagem e ancoragem molecular da LbSRPK com os compostos SRVIC22 e SRVIC32 derivados do SRPIN340. A predição da LbSRPK foi realizada pelo servidor online Modeller, utilizando como base a modelagem comparativa com a SRPK1 humana cristalizada depositada no Protein Data Bank (PDB ID 4WUA). O modelo gerado com menor desvio quadrático médio passou por minimização de energia utilizando o servidor YASARA e, posteriormente, foi validado através de parâmetros estruturais pelos algoritmos dos servidores Verify 3D, ProCheck e ProSa-Web. O modelo validado foi submetido à ancoragem molecular com dois ligantes derivados do SRPIN340 por meio do Autodock e Autodock Vina. Os resultados obtidos para LbSRPK sugerem interações semelhantes dos ligantes com os resíduos conhecidos na proteína homóloga humana e seu inibidor. No entanto, o algoritmo utilizado não foi capaz de compreender as ressonâncias de grupamentos químicos dos ligantes e, portanto, se faz necessário a utilização de uma nova abordagem para a geração de conformações de maior qualidade e interações mais precisas. O presente trabalho sugere que o estudo in sílico referente à inibição da LbSRPK possa contribuir para a seleção de novos alvos farmacológicos, auxiliando na terapia contra a leishmaniose tegumentar.
Palavras-chave Leishmaniose, Inibidores, Ancoragem molecular
Forma de apresentação..... Vídeo
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