Conexão de Saberes e Mundialização
20 a 23 de outubro de 2015
Trabalho 5398
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Exatas e Tecnológicas |
| Área temática | Teoria e Tecnologia da informação |
| Setor | Instituto de Ciências Exatas e Tecnológicas |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Primeiro autor | Igor Rodrigues Ribeiro |
| Orientador | JOÃO FERNANDO MARI |
| Título | Segmentação de células em imagens de microscopía |
| Resumo | A identificação manual de células em imagens de microscopia é um processo difícil, tedioso, que demanda muito tempo do profissional responsável e, consequentemente, sujeito a falhas. Técnicas e algoritmos de processamento de imagens digitais possibilitam automatizar grande parte desse processo, tornando-o mais eficiente e preciso. O objetivo deste trabalho é aplicar algoritmos de processamento de imagens para a segmentação das células em imagens de microscopia óptica. No trabalho são testadas diferentes técnicas para o pré-processamento das imagens, para posterior aplicação do algoritmo Watershed (divisor de águas) para a segmentação. O algoritmo Watershed é adequado principalmente para separar grupos de células sobrepostas nas imagens. Um dos principais problemas do Watershed é definir marcadores únicos para cada célula. Dessa forma, serão testadas diferentes estratégias para definição desses marcadores. Entre os algoritmos testados para a definição dos marcadores podem-se destacar: a captura de mínimos regionais e o algoritmo h-minima, ambos aplicados sobre a transformada de distância da imagem. O trabalho está sendo desenvolvido na linguagem Python por se tratar de uma linguagem moderna, de alto nível e que possui módulos para computação cientifica e numérica. Os experimentos são realizados em cinco etapas: seleção das imagens, aplicação das técnicas de pré-processamento, segmentação por limiarização, aplicação do algoritmo Watershed e por fim a validação dos resultados. Nas etapas de pré-processamento e segmentação são testados diferentes algoritmos como: filtros espaciais, limiarização pelo algoritmo de Otsu e algoritmos de morfologia matemática. Os resultados são submetidos a uma etapa de validação, em que são calculados os índices de Jaccard, Rand e Hausdorff para mensurar a qualidade de cada uma das soluções. Ao realizar experimentos com diferentes algoritmos para cada etapa e diferentes parâmetros para cada algoritmo, busca-se selecionar os que apresentam os melhores resultados. Pretende-se demonstrar, a partir da análise dos resultados, que o algoritmo Watershed pode ser utilizado com êxito no processo de segmentação e que é possível definir um conjunto de ferramentas para o pré-processamento das imagens que possibilitem melhorar os resultados obtidos. |
| Palavras-chave | Segmentação de imagens, Microscopia óptica, Watershed |
| Forma de apresentação..... | Painel |