"A Transversalidade da Ciência, Tecnologia e Inovações para o Planeta"

5 a 7 de outubro de 2021

Trabalho 15905

ISSN 2237-9045
Instituição Universidade Federal de Minas Gerais
Nível Pós-graduação
Modalidade Pesquisa
Área de conhecimento Ciências Biológicas e da Saúde
Área temática Ciência da computação
Setor Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular
Bolsa CAPES
Conclusão de bolsa Não
Apoio financeiro CAPES
Primeiro autor Elizabeth Regina Alfaro Espinoza
Orientador MARIA CRISTINA BARACAT PEREIRA
Outros membros Alessandra Conceição Faria-Campos, Lucas Ferreira Paiva, Sérgio Vale Aguiar Campos
Título Um guia interativo web FluxPRT como apoio para um pipeline adaptável de proteômica
Resumo A proteômica é uma área que tem trazido informações e descobertas científicas de extrema importância, os métodos experimentais dentro desta área vêm se desenvolvendo e a quantidade de informação gerada é cada vez maior e mais difícil de organizar e rastrear. Os sistemas de gerenciamento de informações de laboratórios (LIMS) permitem ágil gestão dos dados e permitem automatizar fluxos de trabalhos, acarretando redução de tempo e custo de um experimento, além de facilitar a transferência de conhecimento. O FluxPRT é um LIMS baseado em um fluxo de trabalho de proteômica que vem sendo desenvolvido dentro do sistema Flux no Laboratório de Universalização de Acesso - LUAR da Universidade Federal de Minas Gerais, o qual tem uma documentação detalhada sobre o funcionamento do sistema e seus componentes. No entanto, torna-se indispensável a criação de uma documentação específica para o FluxPRT, que oriente o delineamento de experimentos por pesquisadores iniciantes. Neste trabalho, apresentamos o desenvolvimento de um guia interativo web como apoio para um pipeline adaptável de proteômica, que integra desde o registro das amostras até a identificação de proteínas. Para a criação deste guia foram compiladas informações presentes na literatura (artigos experimentais e de revisão, cursos mooc, entre outros) para orientar o preenchimento das atividades do fluxo de trabalho e seus componentes (atributos e registros), presentes no sistema FluxPRT. O guia foi organizado em uma página web, implementada em HTML, CSS e javascript. O fluxo de trabalho é apresentado na página web e o usuário pode clicar nas atividades para ver informações a seu respeito. Além disso, toda informação foi organizada em um ebook que pode ser acessado pela página web. A página foi projetada para passar informações significativas para ferramentas de leitura de tela, almejando a acessibilidade de pessoas cegas. Além disso, as informações visuais do ebook foram testadas em simulador de daltonismo. A conexão da guia com o sistema FluxPRT foi feita inserindo um texto breve com a explicação do atributo alvo e um link de redirecionamento na página web. O guia interativo tem informações sobre o cadastro dos experimentos, protocolos para obtenção de material fonte de proteínas, como fazer extração e quantificação das proteínas, cromatografia, espectrometria de massas, como realizar pesquisa em banco de dados e identificação de proteínas. Com este guia espera-se auxiliar os usuários FluxPRT a delinear seus experimentos definindo a sequência de etapas a serem seguidas de forma a responder a pergunta biológica desejada. Para validar esse guia, devem ser realizados testes com usuários que já utilizam o pipeline de proteômica, a fim de avaliar quão significativo é o uso do guia para se ter um pipeline com menos erros e também se tenha uma leitura mais precisa dos resultados gerados.
Palavras-chave LIMS, proteômica, pipeline
Forma de apresentação..... Vídeo
Link para apresentação Vídeo
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