"A Transversalidade da Ciência, Tecnologia e Inovações para o Planeta"
5 a 7 de outubro de 2021
Trabalho 15555
| ISSN | 2237-9045 |
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| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Bioquímica |
| Setor | Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular |
| Bolsa | PIBIC/CNPq |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | CNPq |
| Primeiro autor | João Victor Marques Gonçalves Assis |
| Orientador | MARIA GORETI DE ALMEIDA OLIVEIRA |
| Outros membros | Angelo José Rinaldi, Neilier Rodrigues da Silva Júnior, Rafael de Almeida Barros, Rafael Júnior de Andrade |
| Título | Análise in silico do complexo formado por dois inibidores de protease (BPTI e SKTI) e tripsinas presentes no intestino de Anticarsia gemmatalis |
| Resumo | As abordagens de manejo de pragas são constantemente desafiadas por herbívoros resistentes e problemas relacionados à saúde e ao meio ambiente. Na verdade, o maior desafio para a agricultura moderna é proteger as safras de pragas e ainda manter a qualidade ambiental. Assim, novas moléculas, com diferentes modos de ação, têm sido buscadas e avaliadas a fim de complementar, ou mesmo substituir, os atuais produtos químicos utilizados no manejo de pragas. Inibidores de proteases afetam a digestão proteolítica de insetos, afetando, a disponibilidade de aminoácidos livres para o desenvolvimento e reprodução. Neste trabalho, o potencial inibitório das proteínas BPTI (inibidor de tripsina pancreática bovina) e SKTI (inibidor de tripsina Kunitz de soja) sobre as enzimas tripsina de A. gemmatalis foi avaliado in silico. O software online Phyre2 foi usado para prever as estruturas tridimensionais de seis (6) sequências de tripsina identificadas no intestino de A. gemmatalis em um trabalho anterior. As estruturas cristalinas do BPTI e SKTI foram obtidas do banco de dados de proteínas (PDB) utilizando os códigos 3LDJ e 1AVX, respectivamente. A postura de ligação e a energia de ligação dos complexos foram obtidas por docking molecular usando CLUSPRO. Além disso, simulações de dinâmica molecular para proteínas BPTI e SKTI em complexo com tripsina de A. gemmatalis foram realizadas. Quatro tipos de interações foram registrados entre o local reativo de SKTI e os resíduos de aminoácidos do receptor: ligação de hidrogênio convencional, alquila, Pi-cátion e Enxofre-X; essas interações e o número de resíduos de aminoácidos participantes foram maiores em comparação com o complexo BPTI-tripsina. No entanto, esse menor número de interações é suficiente para corresponder à afinidade de SKTI, uma proteína inibidora de massa maior com um maior número de interações com tripsina do que o BPTI. As sequências que ligam as tripsinas de A. gemmatalis fazem parte de uma única alça (BPTI) ou duas alças (SKTI), estabilizadas por hidrogênio ou ligações hidrofóbicas, conforme demonstrado no perfil farmacofórico após dinâmica molecular. Esses loops são comuns em inibidores de protease e são chamados de RCL (Reactive Center Loops) e medeiam as interações entre BPTI e SKTI com tripsinas de A. gemmatalis. A análise de energia via docking e experimentos de dinâmica molecular destacaram este segmento de alta afinidade no BPTI (YGGCRA), onde cada um dos resíduos de aminoácidos teve uma contribuição energética diferente na formação do complexo, entrando no conceito de hot-spots para Complexo BPTI-tripsina e candidatos dignos para peptídeos inibidores, ou pelo menos pistas promissoras para projetar pequenas moléculas inibitórias e peptídeos com afinidade, estabilidade e biodisponibilidade aumentadas. |
| Palavras-chave | inibidor de tripsina pancreática bovina, inibidor de tripsina Kunitz de soja, bioinformática |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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