"A Transversalidade da Ciência, Tecnologia e Inovações para o Planeta"

5 a 7 de outubro de 2021

Trabalho 15452

ISSN 2237-9045
Instituição Universidade Federal de Viçosa
Nível Graduação
Modalidade Pesquisa
Área de conhecimento Ciências Biológicas e da Saúde
Área temática Bioquímica
Setor Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular
Conclusão de bolsa Não
Apoio financeiro CAPES, CNPq, FAPEMIG, Outros
Primeiro autor Filipe Vilaça Guimarães de Oliveira
Orientador TIAGO ANTONIO DE OLIVEIRA MENDES
Outros membros Bruno Ribeiro Pinto
Título Predição do modelo computacional metabólico da bactéria Brucella suis causadora da brucelose suína
Resumo As bactérias do gênero Brucella são responsáveis por infectar diversas espécies de mamíferos. De bovinos a suínos, chegando até em seres humanos, essas bactérias gram-negativas, aeróbicas e em formato de cocobacilo se instalam principalmente nos tecidos reprodutivos do hospedeiro. A espécie Brucella suis adaptou-se para infectar preferencialmente suínos, podendo causar abortos, infertilidade temporária ou permanente, inflamação, dor ao caminhar e paralisia dos membros inferiores. A contaminação se dá através do contato com animais infectados e, infelizmente, não existe tratamento para animais. Sendo assim, o controle da transmissão é realizado por meio da eutanásia dos animais infectados e testagem dos demais. Logo, trata-se de um patógeno de interesse econômico e de saúde pública, sendo seu estudo e monitoramento ações chaves para reduzir seu impacto na sociedade. Uma maneira eficaz e barata de estudar um organismo é produzindo um modelo computacional metabólico sobre ele. Modelos metabólicos são arquivos contendo as vias metabólicas realizadas por um determinado sistema biológico, além de possuir informações sobre as enzimas, os metabólitos e detalhes sobre espontaneidade e localização de cada reação. De posse de tal ferramenta, é possível predizer o comportamento do organismo em questão e realizar edições em genes específicos in silico. Sendo assim, o objetivo desse trabalho é produzir um modelo computacional metabólico de B. suis para estudo integrativo e comparativo com as bactérias do mesmo gênero, como B. abortus e B. melitensis. Para produção do modelo, foi necessário realizar a reconstrução metabólica automatizada a nível de genoma do organismo de interesse. Para isso, obteve-se os dados de ômica dos bancos KEEG, BRENDA e BiGG Models. Com posse dessas informações, um arquivo draft foi produzido. Tal arquivo passou por uma curadoria manual para garantir o preenchimento de dados faltantes e incorretos e garantir que as reações metabólicas estejam balanceadas. Posterior a essa etapa, foi realizada a conversão da reconstrução metabólica em um modelo matemático. Essa conversão é necessária para possibilitar análises dos fluxos metabólicos pelas ferramentas computacionais, tendo como base as propriedades do sistema e as restrições físico químicas adotadas. Após isso, o software COBRApy é utilizado para aplicar as análises por restrição no modelo matemático, sendo a equação de produção de biomassa a função objetiva dessa análise. Dessa forma, é possível observar quais vias estão ativas ou não durante o desenvolvimento bacteriano, realizando o FBA, Fluxo Balance Analysis, com base na função objetiva de interesse para otimizar o metabolismo. A produção de tal modelo é importante para elucidar os mecanismos patogênicos da B. suis, gerando dados imprescindíveis para estudos e controle do patógeno.

Financiamento: CNPq, FAPEMIG, CAPES, Bill and Melinda Gates Foundation.
Palavras-chave Modelo metabólico computacional, Brucellose suína, Biologia de sistemas.
Forma de apresentação..... Painel
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