"A Transversalidade da Ciência, Tecnologia e Inovações para o Planeta"
5 a 7 de outubro de 2021
Trabalho 15386
| ISSN | 2237-9045 |
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| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Genética |
| Setor | Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde - Campus Rio Paranaíba |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Primeiro autor | Rafael Augusto Silva Soares |
| Orientador | KARINE FREHNER KAVALCO |
| Outros membros | Fabiano Bezerra Menegidio, Igor Henrique Rodrigues Oliveira, Iuri Batista da Silva, RUBENS PASA |
| Título | Primeiro genoma mitocondrial descrito para Stephanoberycidae (Acanthochaenus luetkenii) |
| Resumo | Stephanoberycidae é uma família de peixes pertencentes à ordem Beryciformes, conhecida por serem peixes de águas profundas, predominantemente batipelágicos e demersais. Atualmente conta com 4 gêneros e 4 espécies válidas, mas não dispõe de nenhum genoma mitocondrial descrito. No presente trabalho, apresentamos o primeiro genoma mitocondrial completo de Acanthochaenus luetkenii (ERR1473899), popularmente conhecido como peixe-espinho, ou pricklefish. Obtivemos os dados brutos no Sequence Read Archive (SRA) do NCBI, e montamos o mitogenoma na plataforma Galaxy Europa utilizando a ferramenta NOVOPlasty v4.2 (disponível em https:||usegalaxy.eu/). Utilizamos como semente o gene mitocondrial citocromo oxidase C subunidade I, (COI) da espécie, disponível no GenBank (EU148068.1). Após a montagem, a sequência circularizada foi anotada funcionalmente através da ferramenta MitoAnnotator do servidor do MitoFish (http:||mitofish.aori.u-tokyo.ac.jp/). A composição de base de nucleotídeos do genoma foi calculada por meio do software Mega X e o conteúdo GC de todos os genes codificadores de proteína (GCPs) foi obtida através da ferramenta web Geecee (https:||www.bioinformatics.nl/cgi-bin/emboss/geecee). O genoma mitocondrial de A. luetkenii apresentou composição e organização padrão dos vertebrados, com 13 genes codificadores de proteína, 22 genes de tRNA, 2 genes de rRNA e a região de controle (D-loop). Todos os PCGs foram localizados na cadeia pesada, exceto o gene nd6, o tamanho do mitogenoma foi de 16,512 pares de bases. A composição de bases do mitogenoma completo foi 28,3% A, 28,6% T, 16% G e 27% C. Cada gene apresentou conteúdo GC de: ATPase 6 40%, ATPase 8 40%, COI 43%, COII 41%, COIII 44%, Cyt b 41%, ND1 44%, ND2 45%, ND3 43%, ND4 42%, ND4L 49%, ND5 42% e o gene ND6 45%. A. luetkenii é o primeiro mitogenoma descrito para Stephanoberycidae, o que irá contribuir fortemente para a elucidação da filogenia e dos padrões moleculares desse grupo e de outros grupos relacionados, em vista da escassez de estudos sobre estes organismos. |
| Palavras-chave | mtDNA, mitogenoma, peixe |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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