"A Transversalidade da Ciência, Tecnologia e Inovações para o Planeta"

5 a 7 de outubro de 2021

Trabalho 15245

ISSN 2237-9045
Instituição Universidade Federal de Viçosa
Nível Graduação
Modalidade Pesquisa
Área de conhecimento Ciências Biológicas e da Saúde
Área temática Microbiologia
Setor Departamento de Microbiologia
Bolsa PIBITI/CNPq
Conclusão de bolsa Sim
Apoio financeiro CAPES, CNPq, FAPEMIG, Outros
Primeiro autor Felipe Bastos de Carvalho
Orientador DENISE MARA SOARES BAZZOLLI
Outros membros Giarlã Cunha da Silva
Título Identificação e análise de genes envolvidos em utilização de fontes de carbono em Streptomyces spp visando o desenvolvimento de meios de cultura alternativos para produção de bioinsumos em sistemas on farming
Resumo O gênero Streptomyces apresenta diversas características de importância biotecnológica, como a produção de metabólitos secundários bioativos amplamente utilizados como antibióticos, antifúngicos, bioherbicidas, dentre outros. Além disso, estas bactérias são conhecidas por atuarem como rizobactérias em controle biológico de patógenos e promotoras de crescimento de plantas, características estas muito atrativas com o foco em otimização da produção agrícola. Assim, o objetivo deste trabalho é identificar a presença de genes de interesse biotecnológico no genoma de três linhagens de Streptomyces spp., a fim de oferecer uma base para escolhas de matéria-prima para a elaboração de meios alternativos para o cultivo destas bactérias em grande escala, podendo esta abordagem otimizar e reduzir custos com o crescimento destas bactérias consideradas bioinsumos em sistemas denominados on farming. As linhagens investigadas neste trabalho foram isoladas e caracterizadas em trabalhos anteriores desenvolvidos por nosso grupo. A partir dos genomas sequenciados foi realizada uma busca por genes que codificam produtos envolvidos em controle biológico e promoção de crescimento. A partir do banco de dados do NCBI (National Center for Biotechnology Information), uma triagem de genes específicos a partir de genomas completos disponíveis de Streptomyces coelicolor A3(2), Streptomyces albulus strain NK660, Streptomyces aquilus strain GGCR-6, Streptomyces rimosus ATCC 10970 e Streptomyces ambofaciens ATCC 23877 foi realizado. Em seguida, a partir das sequências obtidas foi realizada uma busca nos genomas das três linhagens de interesse utilizando a ferramenta Blast nucleotide a fim de averiguar a presença destes genes, além de obter outras informações importantes para as análises seguintes. Posteriormente, o programa SnapGene foi utilizado para o mapeamento dos genes nos genomas com base nos dados de alinhamento dos genes de referência resultantes do Blastn. O Blast protein foi utilizado para confirmar a função dos respectivos genes. A partir do mapeamento dos genes de interesse nos três genomas, foi feito uma análise na organização gênica também utilizando o SnapGene. Em nossas análises foram encontrados um número expressivo de genes relacionados a diversas atividades enzimáticas, como chitinases, lipases, asparaginases, xilanases, proteases, celulases, beta galactosidases, glutaminase, etc. Ao analisar os genes no SnapGene foi possível confirmar qual o produto de cada uma das regiões apontadas no primeiro Blast. Este trabalho representa uma abordagem otimizada a partir de dados genômicos para o desenvolvimento e otimização de meios de cultura alternativos com o uso de recursos naturais normalmente descartados para o cultivo e utilização de Streptomyces spp em sistemas on farming.
Palavras-chave Streptomyces, Biotecnologia, Bioinsumos
Forma de apresentação..... Painel
Link para apresentação Painel
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