"A Transversalidade da Ciência, Tecnologia e Inovações para o Planeta"
5 a 7 de outubro de 2021
Trabalho 14679
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Microbiologia |
| Setor | Departamento de Microbiologia |
| Bolsa | PIBIC/CNPq |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | CNPq |
| Primeiro autor | Kiara França Campos |
| Orientador | MATEUS FERREIRA SANTANA |
| Outros membros | Alexia Suellen Fernandes |
| Título | Identificação e caracterização de transposons em genomas das 10 bactérias fitopatogênicas de maior impacto econômico e científico. |
| Resumo | Os transposons são elementos genéticos móveis do genoma que possuem a capacidade de gerar mutações e recombinações ectópicas, modificar a expressão gênicas, e também carregar genes de valor adaptativo, como genes relacionados à virulência e resistência. Assim, esse trabalho teve como objetivo investigar as possíveis implicações da presença de transposons em genomas completos pertencentes às 10 fitobactérias de maior relevância científica e econômica. Trezentos genomas completos pertencentes às espécies Pseudomonas syringae, Ralstonia solanacearum, Agrobacterium tumefaciens, Xanthomonas oryzae pv. Oryzae, Xanthomonas campestris pathovars, Xanthomonas axonopodis, Erwinia amylovora, Xylella fastidiosa, Dickeya (dadantii e solani), Pectobacterium carotovorum e Pectobacterium atrosepticum foram obtidos do NCBI. Os transposons foram identificados pelos programas ISfinder, ISsaga, Oasis e TnCentral. A caracterização dos transposons foi feita usando os programas UGENE e ORFfinder. Já a anotação das ORFs foi realizada via BLAST contra o banco de dados do UNIPROT, Virulence Factors Database, Pathogen–Host Interactions, database, Type III Secretion System Database, The Comprehensive Antibiotic Resistance Database, ResFinder 4.0. No total, foram identificados 77 transposons em cinco espécies (Ralstonia solanacearum, Pseudomonas syringae, Xanthomonas campestris, Xanthomonas oryzae e Xanthomonas axonopodis). A análise dos genes cargos possibilitou a identificação, no elemento TN7263, de um gene de resistência à estreptomicina, que tem sido usado na agricultura para combater doenças bacterianas. Foram também identificados genes cargos relacionados à virulência nos elementos TN7262 e TN7288. Esses genes estão relacionados ao sistema de secreção do tipo 3 e no caso do elemento TN7262, este foi também identificado em diferentes bactérias fitopatogênicas. Análises filogenéticas dos transposons evidenciaram um padrão de agrupamento dos elementos semelhante aos identificado na árvore da região 16S. Entretanto, também foram evidenciados agrupamentos atípicos indicando possível transferência horizontal de genes. Portanto, conclui-se que estudo genético desses elementos móveis, juntamente com os genes cargos e os mecanismos de dispersão desses elementos, é de extrema importância para entender o envolvimento dos mesmos na virulência e adaptação de bactérias fitopatogênicas. |
| Palavras-chave | Elementos genéticos móveis, adaptação, virulência |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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