Bioeconomia: Diversidade e Riqueza para o Desenvolvimento Sustentável
21 a 25 de outubro de 2019
Trabalho 11971
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Ciências Agrárias |
| Setor | Departamento de Zootecnia |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Primeiro autor | Caroline Pereira de Abreu |
| Orientador | RENATA VERONEZE |
| Outros membros | Amanda Botelho Alvarenga, Carla Galvão Fernandes, Haroldo Mendonça Júnior, Sábata Cristina Januário Raimundi |
| Título | Predição genômica de animais cruzados utilizando Single Step GBLUP ponderado |
| Resumo | A performance de animais cruzados não é predita de forma eficiente utilizando somente dados das raças puras devido às diferenças genéticas, interação genótipo x ambiente, dentre outros fatores. Além disso, não existe um consenso na literatura a respeito de qual seria a melhor metodologia para predição da performance de animais cruzados utilizando dados genômicos. Assim, objetivou-se avaliar dois cenários baseados no método Single Step GBLUB ponderado (WssGBLUP) para a predição genômica de animais cruzados por meio de dados simulados. Utilizando o software QMSim, foram simuladas populações mimetizando animais Bos indicus (L1) e Bos taurus (L2) e a partir dessas populações simulou-se animais F1 (F1-1, F1-2, F1-3 e F1-4), que diferem quanto ao número de gerações de distância em relação aos animais puros utilizados na predição (1, 2, 3 ou 4 gerações). A característica simulada foi o consumo alimentar residual (herdabilidade = 0,33 e variância fenotípica = 12,5). As avaliações genéticas foram realizadas utilizando os programas da família BLUPF90. Foi utilizado modelo unicaracterístico: y=Xb+Zu+e, em que é o vetor de observações; é o vetor de efeitos fixos (média); é o vetor de efeitos genéticos aditivos, e é o vetor de resíduo aleatório, X e Z são matrizes de incidência. No cenário 1 (C1) as populações L1, L2 e F1 (F1-1 e F1-2) foram avaliadas conjuntamente como uma única população de referência e as ponderações obtidas de forma tradicional no método WssGBLUP. No C2 somente L1 e L2 foram utilizadas como população de referência e as ponderações utilizadas no WssGBLUP foram estimadas usando somente observações de animais cruzados (F1-1 e F1-2), com o objetivo de explorar a arquitetura genética desses animais, visto que o propósito é melhorar a performance desse grupo. A população de validação foi formada pelos animais cruzados (F1-3 e F1-4) e a acurácia de predição foi calculada utilizando a correlação de Pearson entre o valor genético predito e o valor genético verdadeiro dos animais cruzados. No C1 observou-se acurácia de 0,10 para F1-3 e de 0,06 para F1-4 e no C2 as acurácias foram 0,09 e 0,04 para F1-3 e F1-4, respectivamente. As acurácias médias dos dois cenários foram comparadas pelo teste t de Student e não diferiram significativamente (p-valor<0,05). Ambos os cenários apresentaram acurácias baixas e insatisfatórias, o que pode ser consequência do design utilizado na simulação. De acordo com o design utilizado na simulação, sugere-se que ponderar a matriz de parentesco genômica utilizando dados de animais cruzados não resulta em melhora da acurácia de predição. No entanto, a avaliação dos mesmos cenários sob diferentes parâmetros da simulação se torna importante para conclusões mais robustas. |
| Palavras-chave | simulação, acurácia, bovinos |
| Forma de apresentação..... | Painel |