Ciência para a Redução das Desigualdades
15 a 20 de outubro de 2018
Trabalho 9470
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Ciências Agrárias |
| Setor | Departamento de Estatística |
| Bolsa | FAPEMIG |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | FAPEMIG |
| Primeiro autor | Marcos Guedes de Lana |
| Orientador | CAMILA FERREIRA AZEVEDO |
| Outros membros | FABYANO FONSECA E SILVA, Marcos Deon Vilela de Resende, MOYSES NASCIMENTO |
| Título | Propostas de metodologias estatísticas baseadas em Redução Dimensional aplicados na Seleção Genômica em Eucalyptus |
| Resumo | A importância do Eucalyptus no cenário econômico mundial é notável, visto que oferece diversos produtos fundamentais para a sociedade. O Brasil é referência na silvicultura do Eucalytus e este mérito se dá em função dos grandes avanços no melhoramento genético de espécies florestais. Na seleção genômica (GWS), os métodos de redução de dimensionalidade são úteis para solucionar a alta dimensionalidade e a multicolinearidade entre as variáveis explicativas, neste caso, os marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Os SNPs são naturalmente abundantes no genoma e são correlacionados em razão do conceito de desequilíbrio de ligação entre eles. Os métodos redução de dimensionalidade, tais como regressão via componentes principais (PCR), quadrados mínimos parciais (PLS) e regressão via componentes independentes (ICR), apesar de não terem sido aplicados a seleção de genômica no melhoramento de espécies florestais, mostram-se eficientes no melhoramento animal. Diante do exposto, o presente trabalho tem como principal objetivo avaliar e comparar a eficiência dos métodos de redução de dimensionalidade em relação aos comumente aplicados a GWS, G-BLUP e BLASSO, na estimação de valores genéticos dos indivíduos e dos efeitos de marcadores SNPs nos fenótipos em dados de Eucalyptus. A população em estudo é composta de 768 clones de Eucalyptus grandis×E.urophylla derivados de um total de 34 famílias de irmãos completos e avaliados no delineamento experimental de blocos incompletos, com uma planta por parcela e 24 a 36 repetições por família. Sete características associadas a rendimento, qualidade de madeira, crescimento e volume, e resistência a doença foram mensuradas. De maneira geral, observou-se que a PCR utilizou 33 a 208 componentes no modelo, o PLS utilizou 4 a 7 componentes e a ICR utilizou o mesmo número que a PCR. O PLS esteve associado ao menor número de componentes, isto está de acordo com a teoria do método, uma vez que o método PLS maximiza a covariância dos componentes com os fenótipos, enquanto que a PCR maximiza a variância dos componentes. De acordo com as estimativas das correlações dos valores genéticos estimados pelos métodos e os fenótipos, pode-se observar que a maior capacidade de predição, na maioria das características, está associada ao método PCR (variando de 0,18 a 0,59). Enquanto, que o método PLS apresentou valores de 0,17 a 0,58 e o BLASSO valores de 0,18 a 0,51, seguidos dos métodos G-BLUP (variando de 0,15 a 0,49) e ICR (variando de 0,13 a 0,45). De modo geral, os métodos de redução de dimensionalidade que apresentaram maior capacidade de predição foram o PLS e a PCR. No entanto, o PLS e a PCR superestimaram os valores genômicos. O BLASSO também esteve associado a uma maior capacidade preditiva e a uma ausência de viés. De modo geral, todos os métodos apresentaram estimativas de herdabilidade inferiores as reportadas pela literatura. |
| Palavras-chave | Predição genômica, Marcadores moleculares, Componentes |
| Forma de apresentação..... | Painel |