ISSN |
2237-9045 |
Instituição |
Universidade Federal de Viçosa |
Nível |
Ensino médio |
Modalidade |
Pesquisa |
Área de conhecimento |
Ciências Agrárias |
Área temática |
Biologia e manejo de doenças e pragas de plantas |
Setor |
Departamento de Fitopatologia |
Bolsa |
BIC-Júnior |
Conclusão de bolsa |
Sim |
Apoio financeiro |
FAPEMIG |
Primeiro autor |
Letícia de Paula Silva |
Orientador |
EDUARDO SEITI GOMIDE MIZUBUTI |
Outros membros |
Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e Ferreira, Braz Tavares da Hora Júnior |
Título |
Anotação inicial do genoma de Pseudocercospora ulei, agente causal do mal-das-folhas da seringueira |
Resumo |
Um dos principais fatores limitadores da produção de borracha natural nas regiões tropicais úmidas da América do Sul é a doença Mal-das-Folhas (MDF), causada pelo fungo Pseudocercospora ulei. Apesar de o Brasil ser o centro de origem da seringueira e de as condições climáticas serem propícias ao desenvolvimento da planta, a produção nacional de borracha natural é deficitária. Atualmente, o país gasta aproximadamente 350 milhões de dólares/ano com a importação de borracha natural para atender a demanda interna. A doença causa queda prematura de folhas, podendo levar as plantas à morte. Para viabilizar a produção de borracha natural no país é necessário investir em clones de seringueira que sejam resistentes ao MDF. Por sua vez, um programa de melhoramento bem sucedido depende do conhecimento das características básicas do fungo e de como este interage com a planta. Nessa premissa, iniciou-se um projeto de sequenciamento completo do genoma de P. ulei na expectativa de obter subsídios que permitirão avançar o entendimento da patogênese e epidemiologia do MDF. O objetivo do trabalho foi iniciar a anotação do genoma de P. ulei. A partir de folhas de seringueira com sintomas do MDF coletadas em Oratórios, MG, obteve-se o isolado MuMG15. Deste isolado extraiu-se o DNA total e este foi submetido ao sequenciamento utilizando a tecnologia 454 FLX Titanium. Obtiveram-se: 2.873.498 de reads, 1.158.042.143 de bases, sendo que 2.343.002 foram usadas para montagem. O número de contigs foi de 37.389; o número de bases foi de 85.600.345; tamanho médio dos contigs foi 2.289 e o N50 foi de 3.295. Cada contig foi utilizado na prospecção visando à anotação inicial. Um sistema foi desenvolvido para automaticamente submeter o contig aos sistemas preditores Augustus, GlimmerHMM, SNAP e Geneid. Foram identificadas 64 lipases, 139 peptidases, 46 proteínas associadas a metabolismo secundário, 8 proteínas efetoras, 32 pequenas proteínas secretadas e 232 proteínas associadas a metabolismo de carboidratos. Novas encontrar número ainda maior de genes que poderão ser potencialmenteprospecções e análises estão sendo realizadas e espera-se úteis para programas de melhoramento de seringueira e para o entendimento de aspectos básicos da biologia de P. ulei. |
Palavras-chave |
Microcyclus ulei, fitopatologia, genética |
Forma de apresentação..... |
Painel |