Resumo |
A caracterização das interações da molécula de DNA com proteínas e drogas é muito importante por permitir uma maior compreensão dos processos intracelulares, bem como aplicações na medicina. A Actinomicina D (ActD) é um potente antibiótico que apresenta uma forte afinidade com o DNA de células cancerosas, impedindo a replicação e consequente crescimento do tumor. Logo, o entendimento detalhado de sua interação pode permitir melhoria nas terapias atuais e desenvolvimento de medicamentos mais eficazes. Neste trabalho, buscou-se analisar as mudanças nas propriedades mecânicas da molécula de DNA sob diferentes concentrações de ActD e a obtenção de parâmetros físico-químicos obtidos pelo ajuste dos dados experimentais com o modelo teórico desenvolvido. Os experimentos consistiram em estiramentos de moléculas únicas de DNA do vírus bacteriófago λ, com uma de suas extremidades adsorvida na lamínula do microscópio e a outra ligada a uma microesfera de poliestireno com diâmetro de 3 µm, sendo esta microesfera manipulada através de pinçamento óptico. Um dos parâmetros de interesse é o comprimento de persistência (A), ligado à rigidez da molécula, que foi estudado em função da razão entre a concentração da ActD na amostra e a concentração de pares de base da molécula de DNA (CT/Cbp). Os resultados mostram que primeiramente o valor cai de ~50 nm (valor para o DNA sem a presença do fármaco, ou seja, CT/Cbp = 0) para ~23 nm quando CT/Cbp = 0,09, depois, aumenta para ~43 nm em CT/Cbp = 0,66 e finalmente, diminui abruptamente para ~25 nm quando CT/Cbp > 0,66. O comportamento inicial de queda e seguinte aumento do comprimento de persistência pode ser atribuído a uma competição entre a ligação com a fenda menor, responsável pela queda do A no regime de baixas concentrações, e a intercalação, responsável pelo aumento do A durante as concentrações intermediárias. Já a queda abrupta ocorre em decorrência de uma desnaturação parcial do DNA. O segundo parâmetro de interesse é o comprimento de contorno (L), que é caracterizado pela distância entre as duas extremidades da molécula quando ela se encontra completamente esticada. Este parâmetro foi analisado graficamente como um aumento relativo de L (ΔL/L0) em função novamente de CT/Cbp, observando-se que o comprimento de contorno cresce quando a ActD se liga ao DNA, assemelhando-se a comportamentos observados para intercalantes. Além dessa análise inicial ainda é possível, através de um modelo estatístico, obter parâmetros físico químicos através do ajuste dos dados experimentais, extraindo ainda mais detalhes da ligação DNA-ActD, constituindo assim uma poderosa ferramenta para estudos posteriores na área. |