Ciência, saúde e esporte: conhecimento e acessibilidade
21 a 26 de outubro de 2013
Trabalho 518
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Pós-graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Genética e melhoramento vegetal |
| Setor | Departamento de Biologia Geral |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Primeiro autor | Lívia Gracielle Oliveira Tomé |
| Orientador | COSME DAMIAO CRUZ |
| Outros membros | Danielle Silva Pinto, Luiza Barbosa da Matta, Rafael Simões Tomaz, Vinícius Quintao Carneiro |
| Título | Estudo de agrupamentos genéticos hierárquicos para análises moleculares simuladas |
| Resumo | Metodologias hierárquicas são amplamente aplicadas em análises de diversidade genética, sendo importante o pesquisador ter conhecimento sobre qual a melhor a ser utilizada. Uma maneira de inferir sobre a diversidade genética é através de métodos de natureza preditiva, em destaque aqueles baseados nas diferenças moleculares, cuja diversidade é expressa por coeficientes de (dis)similaridade e medidas de distância genética. Neste trabalho avaliaram-se os métodos de análise da diversidade genética baseados em informações genotípicas aplicados a um sistema hierárquico previamente conhecido – sistema de retrocruzamentos. O potencial das medidas de dissimilaridade foi estudado para a avaliação da diversidade genética no melhoramento genético, bem como as técnicas de análise de agrupamento hierárquico. Dois conjuntos de dados simulados (i: populações genitoras P1 e P2 e sua F1 híbrida e cinco gerações de retrocruzamento, totalizando 13 gerações submetidas à análise; ii: obtido de forma similar ao primeiro, gerações de retrocruzamento foram derivadas de duas outras populações, P3 e P4). Em cada conjunto populacional, os 200 indivíduos consistiam em 20 locos, manifestando dois alelos codominantes. Os dados genotípicos destas 26 populações foram utilizados para o cálculo de uma medida de dissimilaridade (índice ponderado) e para o estudo diversidade genética por meio dos métodos de agrupamento hierárquico: Método de Gower, Ligação média dentro de grupo, Ligação média entre grupo, Vizinho mais distante, Vizinho mais próximo, Método de Ward, Método da mediana. As metodologias hierárquicas foram eficientes em agrupar populações de acordo com o padrão de agrupamento esperado com base no delineamento genético fundamentado em genitores, geração híbrida e derivadas de retrocruzamentos de ambos genitores. O método do Vizinho Mais Próximo foi o mais eficiente em reconstituir a realidade para um único sistema de retrocruzamento, apesar de não ter apresentado a maior correlação cofenética. Dentre as análises de agrupamento hierárquico cujas medidas de dissimilaridade foram para dois sistemas de retrocruzamento, o Método da Mediana (WPGMA) foi o que melhor reconstituiu a estrutura. Entretanto, em relação, ao método estatístico, a posteriori, correlação cofenética, o método Ligação Média Entre Grupo(UPGMA) foi o que apresentou a maior estimativa para gerações híbridas derivadas de retrocruzamentos a partir de dois e quatro genitores. |
| Palavras-chave | métodos de agrupamento hierárquico, diversidade genética, retrocruzamento. |
| Forma de apresentação..... | Painel |