ISSN | 2237-9045 |
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Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
Nível | Graduação |
Modalidade | Pesquisa |
Área de conhecimento | Ciências Exatas e Tecnológicas |
Área temática | Física teórica, experimental e de simulação |
Setor | Departamento de Física |
Bolsa | FAPEMIG |
Conclusão de bolsa | Sim |
Apoio financeiro | CNPq, FAPEMIG |
Primeiro autor | Filomeno Soares de Aguiar Junior |
Orientador | JOSE ESIO BESSA RAMOS JUNIOR |
Outros membros | MARCIO SANTOS ROCHA |
Título | Estudo da interação da molécula de DNA com Actinomicina-D por meio de Microscopia de Força Atômica |
Resumo | Os aspectos mecânicos e conformaiconais de moléculas de DNA estão freqüentemente associados com vários processos celulares, que vão desde a regulação da expressão gênica ao empacotamento da cromatina no interior do núcleo de células eucarióticas. Dobras acentuadas, por exemplo, ao longo da molécula de DNA , são observados quando proteínas ou ligantes formam complexos em locais específicos da molécula de DNA, desempenhando um importante componente estrutural no contexto de determinadas mecanismos de regulação como os da replicação e transcrição gênica. Em nosso trabalho, buscamos estudar as alterações conformacionais da molécula de DNA quando da sua interação com um importante antibiótico e anticarcinogênico actinomicina-D. Para realização desse estudo, a molécula de DNA utilizada foi o plasmídeo PUC 118 com 3162 pares de base e com um comprimento de contorno de aproximadamente 1 micrômetro. As amostras foram preparadas com o plasmídeo diluído em Tris 10mM + 10mM de MgCl2 e concentrações variadas da actinomicina-D. Um volume total de aproximadamente 20 microlitros foi depositados sobra a mica, substrato que foi utilizado para a realização de imagens no AFM operando no modo semi-contato. Observamos através da analise das imagens que a actinomicina induz dobras nítidas nas moléculas de DNA, alterando sua conformação, em conformidade com estudos anteriores por meio difração de raios-X e ressonância nuclear magnética (RNM). O número de moléculas com essas dobras dependia claramente da concentração do ligante. Estimamos que o valor dos ângulos de dobramento esteja por volta de 80-87 graus aproximadamente, para todas as concentrações da actinomicina-D. O número médio de dobras por molécula de DNA varia significativamente em função da concentração da droga. Estimamos que a freqüência de ocorrência de 1 e 2 dobras por molécula de DNA aumentava em função do aumento da concentração da droga, enquanto para 3 ou mais dobras ocorriam o aumento da freqüência até uma dada concentração, diminuindo para maiores concentrações da Act-D em solução. Esse resultado está em concordância qualitativa com o comportamento não monótono do comprimento de persistência da molécula de DNA em função da concentração da droga, medido usando a pinça ótica. |
Palavras-chave | DNA, actinomicina-D, AFM |
Forma de apresentação..... | Painel |