Ciência, saúde e esporte: conhecimento e acessibilidade
21 a 26 de outubro de 2013
Trabalho 365
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Genética e melhoramento animal |
| Setor | Departamento de Zootecnia |
| Bolsa | PIBITI/CNPq |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | CNPq |
| Primeiro autor | Máira Pedroso de Almeida |
| Orientador | SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARAES |
| Outros membros | Débora Martins Paixão, Carlos Souza do Nascimento, Margareth Evangelista Botelho |
| Título | Identificação parental e estimação de coeficientes de endogamia e parentesco em suínos utilizando SNPs |
| Resumo | No melhoramento animal, informação completa e confiável de pedigree é extremamente essencial para atingir o progresso genético, uma vez que a presença de erros pode reduzir o ganho esperado. Contudo, a matriz de parentesco utilizada usualmente, baseada em pedigrees tradicionais, muitas vezes apresenta perda de precisão devido ao registro de informações erradas e/ou incompletas, o que resulta em uma super ou subestimação dos coeficientes de endogamia e de parentesco. Para solucionar estes problemas, o uso de marcadores moleculares tem sido proposto, mas o número ideal a ser utilizado nas análises ainda não está bem definido. O principal objetivo deste estudo foi avaliar o número de SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) informativos necessários para a estimação de endogamia e do grau de parentesco, além da identificação de paternidade. Três linhas comerciais de suínos (Duroc, Large White e Pietrain) foram genotipadas usando a plataforma Illumina PorcineSNP60 Beadchip. Um total de 878 animais foi incluído nas análises de paternidade e 1565 nas análises de parentesco baseadas em informações moleculares. Para avaliar o número de marcadores necessário para identificação parental, cinco painéis de SNPs (n = 40, 60, 80, 100 e 120) foram testados. Já a endogamia e o parentesco foram estimados utilizando: todos os marcadores disponíveis, marcadores em equilíbrio de ligação (marcadores LE) e seis subconjuntos de SNPs (n = 500, 1000, 1500, 2000, 2500 e 3000). Parentesco genômico foi estimado apenas para os animais que tiveram a paternidade confirmada por testes de DNA (n = 645). Para o estudo de identificação parental, observou-se que 100 SNPs com alto sucesso de genotipagem (> 90%) são suficientes para atribuir o pai verdadeiro sem o conhecimento do genótipo da mãe. Os coeficientes de endogamia e parentesco genômicos podem ser estimados com maior precisão utilizando um conjunto reduzido de marcadores LE. Subconjuntos de 2000 – 3000 SNPs são capazes de reproduzir eficientemente os resultados obtidos quando todos os marcadores LE estão disponíveis. Portanto, o uso de SNPs para investigar a endogamia, o grau de parentesco e a paternidade entre animais, na ausência de informações de pedigree, mostrou-se viável e robusto, sendo uma ferramenta valiosa para alcançar maior progresso genético do rebanho. |
| Palavras-chave | teste de paternidade, endogamia, marcador molecular |
| Forma de apresentação..... | Oral |