Ciência, saúde e esporte: conhecimento e acessibilidade
21 a 26 de outubro de 2013
Trabalho 1720
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Genética e melhoramento vegetal |
| Setor | Departamento de Biologia Geral |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Apoio financeiro | CAPES, CNPq, FAPEMIG, FUNARBE, SICOOB-UFVCredi |
| Primeiro autor | Antônio Carlos da Silva Júnior |
| Orientador | LEONARDO LOPES BHERING |
| Outros membros | Amaro Afonso Campos de Azeredo, Bruno Ermelindo Lopes Gomes, Humberto Fanelli Carvalho, Leonardo de Azevedo Peixoto |
| Título | Mapeamento de características oligogênicas em duplo-haplóide |
| Resumo | Mapeamento de características oligogênicas em duplo-haplóide Antônio Carlos da Silva Júnior1, Leonardo Lopes Bhering2, Bruno Ermelindo Lopes Gomes1, Humberto Fanelli Carvalho3, Leonardo de Azevedo Peixoto4 e Amaro Afonso Campos de Azeredo4 1 Estudante de graduação em agronomia 2 Professor adjunto do Departamento de Biologia Geral 3 Estudante de mestrado do programa de pós-graduação em Genética e Melhoramento 4 Estudante de doutorado do programa de pós-graduação em Genética e Melhoramento Resumo - As características oligogênicas são aquelas que apresentam distribuição discreta e expressão governada por poucos genes de maior efeito sendo importantes na condução de programas de melhoramento de várias culturas. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de mapeamento por intervalo simples para detecção de Oligogenic Trait Loci (OTL) em diferentes tamanhos de populações de duplo-haplóides. Foram utilizados dois tamanhos de populações com 150 e 1000 indivíduos e para cada tamanho foram simuladas 100 réplicas (repetições). O programa utilizado para as simulações e análises foi o GQMOL. Em cada réplica foi simulada cinco características: C1 – com dois genes com efeito sobre a expressão da característica de 50 e 30%; C2 – com três genes com efeito de 50, 20 e 10%; C3 – com um gene com efeito de 80%; C4 - com dois genes com efeito de 40% cada; e C5 – com dois genes com efeito de 50% cada. Para verificar a eficiência do processo foi calculado o valor de LOD escore. O mapeamento por intervalo simples mostrou-se eficiente para detecção do OTL em todas as características avaliadas nos dois tamanhos de população. Na população com 1000 indivíduos todos os OTLs foram encontrados na posição correta, porém nas populações com 150 indivíduos houve detecção de OTLs em posições erradas no genoma principalmente nos OTLS de menor efeito. O método de mapeamento por intervalo simples é mais eficiente na detecção do OTL na marca simulada quando o efeito do gene sobre a característica é baixo (10 a 30%) em populações com maior número de indivíduos. Observou-se que quanto maior o efeito do OTLs na expressão da característica, maior é o valor de LOD para o OTL. Nas populações de 100 indivíduos o valor de OTL foi maior que nas populações com 150 indivíduos em todas as características simuladas. Assim concluímos que populações com 150 indivíduos não são eficientes para detecção de OTL pelo método de mapeamento por intervalo simples, e uma população com 100 indivíduos é suficiente para detectar QTLs na posição correta no genoma. |
| Palavras-chave | estatística genômica, detecção de QTL, mapeamento intervalo simples |
| Forma de apresentação..... | Painel |