| Resumo |
O Híbrido de Timor (HdT), provavelmente originado de um cruzamento natural entre Coffea arabica e Coffea canephora, é amplamente utilizado em programas de melhoramento do café devido à sua significativa resistência a várias raças de Hemileia vastatrix. Esse fungo atinge principalmente a espécie C. arabica, causando enormes prejuízos econômicos ao setor cafeeiro mundial. O HdT CIFC 832/2 destaca se por apresentar resistência mais duradoura do que outros acessos, além de respostas rápidas ao patógeno. Esse acesso também possui resistência a outras doenças e é compatível em cruzamentos com cultivares de C. arabica, facilitando a transferência de seus alelos de resistência. O objetivo deste estudo foi mapear o gene pertencente a família gênica LRR-RLK - Leucine-rich repeat receptor like kinase do HdT CIFC 832/2 em mapa genético e realizar a interação com proteínas efetoras de H. vastatrix. Para o mapeamento, foi amplificado um marcador molecular correspondente ao gene RLK em 247 genótipos de uma população de mapeamento F2, oriundos do cruzamento de HdT UFV 443-03, parental resistente, com Catuaí Amarelo IAC 64 (UFV 2148-57), parental suscetível. Os dados do marcador foram codificados e então analisados usando o software GENES. Grupos de ligação (GL) foram formados e ordenados usando um escore LOD mínimo de 3,0 e um valor máximo de recombinação de 30%. As frequências de recombinação estimadas foram convertidas em distâncias genéticas (centiMorgans; cM). Para a identificação das interações proteína-proteína foram integrados três métodos de predição distintos, PEIMAP, PSIMAP e iPfam. As sequências de aminoácidos dos genes LRR-RLK, juntamente com o conjunto total de proteínas de genoma de H. vastatrix foram alinhadas com as sequências presentes em cada um dos bancos de dados. Para o PEIMAP, os alinhamentos com, no mínimo, 40% de identidade e 70% de cobertura foram considerados significativos. Para o PSIMAP e iPfam, foram considerados os alinhamentos com e-value menor ou igual a 1x10-4. Cada método de predição de interação atribui um escore de confiabilidade e os resultados são integrados e normalizados entre 0 e 1. Apenas interações com escore > 0,7 são mantidas. Em seguida, filtra-se proteínas de H. vastatrix que sejam secretadas ou de superfície, conforme predições de SignalP, TMHMM, WoLF PSORT e Phobius. O gene LRR-RLK ficou mapeado no GL 5 do mapa genético de ligação. Na rede de interação proteína-proteína foram identificadas 158 proteínas de H. vastatrix interagindo com as proteínas codificadas pelos genes RLK. Uma vez realizada a filtragem por meio das proteínas secretadas e/ou de superfície de H. vastatrix, restaram 50 proteínas na rede de interação com as proteínas de cafeeiro. Essas informações são de grande importância para o programa de melhoramento do cafeeiro, pois permitem a identificação de genes candidatos a resistência e a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na defesa contra a ferrugem. |