| Resumo |
Registros genealógicos são essenciais para a eficiência de programas de melhoramento genético de plantas, pois orientam estratégias de seleção e cruzamento e subsidiam modelos estatísticos de predição de valores genéticos. No entanto, o registro da genealogia pode ser laborioso, incompleto e sujeito a erros. Marcadores moleculares, como polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), são ferramentas úteis para validar, corrigir ou inferir relações de parentesco. Em culturas poliploides e alógamas, como a batata-doce (Ipomoea batatas, 2n = 6x = 90), a análise de parentesco é especialmente complexa, devido às suas características genômicas e de herança. Nesse contexto, este trabalho teve como objetivo verificar e, quando necessário, corrigir a genealogia anotada de duas populações de melhoramento de batata-doce utilizando SNPs, bem como desenvolver um protocolo de validação de parentesco em espécies poliploides. As populações avaliadas são originárias de Uganda: a primeira composta por 312 indivíduos e 22 genitores putativos, e a segunda por 1072 indivíduos e 39 genitores putativos. Indivíduos e genitores foram genotipados por meio da tecnologia DArTag para cerca de 3000 SNPs. Após controle de qualidade e remoção de marcadores em alto desequilíbrio de ligação (r2 > 0,20), mantiveram-se 2246 marcadores na primeira população e 1159 na segunda. A fim de investigar o efeito da densidade de marcadores na análise, conduziu-se a amostragem aleatória de 20, 50 e 80 de marcadores para cada cromossomo. Os dados genéticos foram submetidos ao software POLYGENE (v.1.7) para a inferência do parentesco, por meio de métodos de verossimilhança. Avaliou-se a concordância entre a genealogia anotada e o parentesco inferido pelo programa, que incluiu a estimativa da confiabilidade dos resultados. Na primeira população, o aumento no número de marcadores por cromossomo resultou em maior confiabilidade, enquanto na segunda, a confiabilidade permaneceu relativamente inalterada. Na primeira população, a concordância entre os pares de genitores anotados e os obtidos variou entre 33,8% e 37,0% (20 e 80 SNPs), e entre apenas um dos genitores, a variação foi de 44,7% e 46,1%. Na segunda população, a concordância entre pares de genitores anotados e obtidos variou entre 34% a 31,4%, havendo uma variação de 45,6% a 31,4% para os casos de coincidência entre apenas um genitor. Neste estudo, constatou-se a importância de incluir todos os possíveis genitores nas análises genético-estatísticas de identificação de parentesco. Além disso, este estudo contribuiu para o desenvolvimento de um protocolo de tratamento de dados genéticos para a verificação do parentesco em espécies poliploides. |