| Resumo |
A ferrugem asiática da soja, causada pelo fungo biotrófico Phakopsora pachyrhizi, é uma das principais doenças da cultura da soja em nível mundial, resultando em expressivas perdas econômicas. Por se tratar de um patógeno obrigatoriamente biotrófico, sua sobrevivência e sucesso infeccioso estão relacionados à capacidade de secretar proteínas, conhecidas como efetores, que manipulam o metabolismo e as defesas da planta hospedeira. Diante disso, o presente trabalho teve como objetivo identificar proteínas candidatas ao secretoma in silico de P. pachyrhizi, priorizando aquelas com características típicas de efetores, por meio de análises bioinformáticas. Partindo de um proteoma inicial contendo 17.220 proteínas, sucessivas etapas de filtragem baseadas em predição computacional reduziram esse número em mais de 96%, resultando em um conjunto final de 573 proteínas candidatas ao secretoma predito. Na primeira etapa, o SignalP 4.1 identificou 1.340 proteínas com peptídeo sinal, característico de secreção pela via clássica. Em seguida, o TargetP 2.0 refinou este número, removendo proteínas direcionadas à mitocôndria, restando 1.336 sequências. Posteriormente, a ferramenta WoLF PSORT foi empregada para estimar a localização subcelular das proteínas, selecionando 978 candidatas preditas como extracelulares. A etapa seguinte empregou o TMHMM 2.0, para identificar proteínas que possuíam domínios transmembranares e eliminá-las, resultando em 686 proteínas com maior probabilidade de serem secretadas para o meio extracelular. Para validar esses dados, a ferramenta Phobius foi utilizada como abordagem complementar, refinando o conjunto para 573 proteínas que possuíam peptídeo sinal e ausência de domínios transmembranares. Por fim, o conjunto refinado foi submetido à análise com o EffectorP 3.0, que identificou 336 proteínas como potenciais efetores, sendo 88 classificados como apoplásticos, 186 citoplasmáticos e 62 com atuação em ambas as localizações. Esses resultados demonstram que uma proporção expressiva do secretoma previsto de P. pachyrhizi está potencialmente envolvida na manipulação do hospedeiro, contribuindo para o sucesso infeccioso do patógeno. A abordagem metodológica baseada em ferramentas de predição in silico demonstrou ser eficiente para refinar grandes conjuntos proteicos e identificar proteínas-chave na interação patógeno-planta. Como conclusão, a análise permitiu a identificação de um subconjunto funcionalmente relevante de proteínas candidatas ao secretoma, oferecendo novos alvos para futuros estudos funcionais e o desenvolvimento de estratégias biotecnológicas de controle da ferrugem asiática da soja. |