“Bicentenário da Independência: 200 anos de ciência, tecnologia e inovação no Brasil e 96 anos de contribuição da UFV”.
8 a 10 de novembro de 2022
Trabalho 16720
| ISSN | 2237-9045 |
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| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Pós-graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Genética |
| Setor | Departamento de Agronomia |
| Bolsa | CAPES |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Apoio financeiro | CAPES |
| Primeiro autor | Helio de Souza Junior |
| Orientador | GUILHERME DA SILVA PEREIRA |
| Outros membros | Carla Cristina da Silva |
| Título | Desenvolvimento de marcadores do tipo KASP putativamente associados a caracteres de qualidade em batata-doce |
| Resumo | A batata-doce, Ipomoea batatas (L.) Lam., é uma importante cultura para segurança alimentar em países em desenvolvimento. Caracteres de qualidade, como cor da casca, cor da polpa e textura, apresentam ampla variabilidade natural e se relacionam com preferências de variedades pelo consumidor. As variedades de batata-doce de polpa alaranjada, por exemplo, são ricas em carotenoides precursores de vitamina A como o β-caroteno, podendo ser empregadas no combate à deficiência desta vitamina. A espécie é autohexaploide (2n = 6x = 90) e alógama, o que confere alta complexidade genômica e dificulta a aplicação de ferramentas genéticas, como os marcadores moleculares. Os polimorfismos de base única (SNPs) são marcadores bialélicos para os quais, em espécies poliploides, é necessária a determinação da dosagem alélica (ou do número de cópias dos alelos). No caso de espécies autohexaploides, como a batata-doce, até sete classes de dosagem por loco (de 0 a 6) podem ser identificadas. Os objetivos do presente estudo foram (i) desenvolver marcadores do tipo kompetitive allele specific PCR (KASP) a partir de SNPs localizados em regiões que controlam caracteres de qualidade em batata-doce, e (ii) caracterizar o polimorfismo e a dosagem alélica desses locos em genótipos de batata-doce de uma população de melhoramento do International Potato Center (CIP) em Uganda. Um total de 60 SNPs foram selecionados em locos ligados aos conteúdos de β-caroteno, α-amilase e açúcares, e à cor da casca. O pacote R fitPoly v3.0.0 foi usado para classificação de 94 genótipos a partir do ajuste modelos de mistura das razões de intensidade dos alelos do SNP produzido via KASP. Oito SNPs foram excluídos, sendo cinco monomórficos e três que falharam para a chamada de doses. Para os 52 marcadores restantes, foi possível realizar a classificação com elevada confiança (P> 0.9) de 71 indivíduos por loco, em média. O número de classes observadas variou de três a sete. Este trabalho demonstra que a técnica de genotipagem via KASP permite a atribuição eficiente de dosagem alélica em populações de melhoramento de batata-doce hexaploide. O conhecimento da dosagem alélica em poliploides é essencial para estudos utilizando marcadores SNPs, já que a dosagem alélica pode afetar a expressão gênica e, em última instância, o próprio fenótipo. Portanto, a determinação de dosagens alélicas é particularmente importante para estudos de genômica funcional, de ligação e de associação. Os marcadores desenvolvidos neste trabalho serão posteriormente avaliados quanto à sua associação aos caracteres de interesse para fins de seleção assistida por marcadores. |
| Palavras-chave | Ipomoea batatas, SNP, kompetitive allele specific PCR. |
| Forma de apresentação..... | Painel |
| Link para apresentação | Painel |
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