Resumo |
A bactéria Ralstonia solanacearum é um dos fitopatógenos mais devastadores em culturas de importância econômica, sendo capaz de infectar cerca de 250 hospedeiros em 54 famílias botânicas. É uma bactéria aeróbica, Gram-negativa, não esporulante, habitante do solo, a qual invade as raízes das plantas, se hospeda no xilema, bloqueando o fluxo de migração de água para folhas o que provoca a murcha na planta e consequentemente a morte. Em razão da extensa variabilidade genética de R. solanacearum, suas linhagens são caracterizadas como um complexo de espécie, o que implica ainda mais nas dificuldades de seu controle. Considerando esta plasticidade genética, os elementos genéticos móveis podem desempenhar um importante papel na diversificação genômica do fitopatógeno. Estes elementos podem ser determinantes para a bactéria se adaptar a novos nichos ecológicos e colonizar novos hospedeiros, pois além de gerarem variabilidade genética podem carregar genes com valores adaptativos. Investigar a dinâmica e distribuição destes elementos nos genomas de R. solanacearum, nos possibilita compreender a diversificação genômica que permite o fitopatógeno driblar os mecanismos de defesa da planta hospedeira. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi analisar e caracterizar os plasmídeos presentes nos genomas de diferentes linhagens de R. solanacearum. Para atingir esse objetivo, 103 genomas de diferentes linhagens pertencentes ao complexo de espécies de R. solanacearum depositados no NCBI (National Center for Biotechnology Information) foram analisados. A detecção de plasmídeos foi realizada utilizando o banco de dados NCBI. A anotação funcional dos genes presentes nos plasmídeos foi realizada através dos softwares Phi-Base e Eggnog. Foram encontrados 8 plasmídeos, predominantemente na espécie R. solanacearum, variando em tamanho entre 35,008 bp a 143,755 bp. Esses plasmídeos carregam genes relacionados à patogenicidade da planta, incluindo proteínas efetoras e proteínas de avirulência. Além disso, os plasmídeos possuem potencial de transmissão, visto que apresentam conteúdos relacionados ao sistema de secreção do tipo 4. Em conclusão, embora não tenham sido encontrados muitos plasmídeos sequenciados, estes carregam genes que codificam proteínas que podem permitir maior adaptação de R. solanacearum. |