ISSN | 2237-9045 |
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Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
Nível | Graduação |
Modalidade | Pesquisa |
Área de conhecimento | Ciências Exatas e Tecnológicas |
Área temática | Física Geral |
Setor | Departamento de Física |
Bolsa | FAPEMIG |
Conclusão de bolsa | Não |
Apoio financeiro | FAPEMIG |
Primeiro autor | Natan de Almeida Fonseca |
Orientador | MARCIO SANTOS ROCHA |
Outros membros | Rayane Maria de Oliveira |
Título | Avaliação dos efeitos das interações de depleção sobre a desnaturação da molécula de DNA induzida por força: um estudo de moléculas únicas |
Resumo | Neste trabalho pretendemos avaliar a interação da molécula de DNA com o polímero neutro polietilenoglicol (PEG) de diferentes pesos moleculares. É sabido que esta interação ocorre através de forças de depleção e pode levar à condensação do DNA dependendo da concentração de PEG e de sal na solução circundante. A pinça óptica, por outro lado, é a técnica experimental indicada para manipulação de cadeias únicas de DNA, bem como para avaliação das forças envolvidas quando este interage com algum tipo de ligante, inclusive no processo de condensação, realizando-se ensaios de força x extensão da molécula. Aqui realizamos ensaios de força x extensão do DNA no regime entrópico e entálpico. Primeiramente exploramos o regime entrópico para verificar se o DNA escolhido é um bom espécime para nosso experimento. Esse regime está limitado a forças que não superem 5 pN, que são aquelas que não alteram a estrutura do DNA quando estirado, isto é, não danificam ligações. Realizamos essa medida cerca de 3 a 5 vezes para ver se o DNA é consistente. Isso é feito para encontrar o comprimento de contorno e de persistência do DNA, que precisam estar próximos de 16,5 μm e 45 nm, respectivamente, para garantir que a dupla-hélice esteja com a sua estrutura sem quebras ou danos significativos. Após encontrarmos um DNA com estes parâmetros, aumentamos a constante de força da pinça e estiramos novamente a molécula, porém agora na presença de PEG, a uma concentração previamente definida. Esse é o regime entálpico, onde as forças são suficientes para eventualmente romper as ligações de hidrogênio que unem a dupla fita e com isso desnaturar o DNA. Para o DNA puro, esta desnaturação induzida por força é muito bem caracterizada e se manifesta através de um platô típico a 65 pN na curva de força x extensão da molécula. Nosso objetivo principal é então estudar como as interações de depleção induzidas pelo PEG modificam esta transição de desnaturação, sob várias condições distintas. Resultados preliminares já foram obtidos e serão apresentados. |
Palavras-chave | Pinça óptica, DNA, Polietilenoglicol |
Forma de apresentação..... | Vídeo |
Link para apresentação | Vídeo |
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