Resumo |
O efeito dos cromossomos supranumerários foi sempre motivo de controvérsia: são eles parasitas ou conferem vantagens adaptativas aos seus portadores? Este estudo analisou a composição molecular destes cromossomos, comparando espécimes não portadores e espécimes portadores de cromossomos B na espécie de curimba. Foram coletados 154 espécimes da Estação de Piscicultura da CEMIG em Volta Grande-MG. Foram selecionados dois espécimes: um sem cromossomos B (0B) e outro com seis cromossomos B (6B), os quais foram utilizados para as análises genômica e proteômica. Para a análise genômica, o sequenciamento foi feito nas plataformas Illumina MiSeq e HiSeq e a plataforma PAC-Bio. Para a análise proteômica, foi feita a focalização isoelétrica das proteínas, as quais foram submetidas à eletroforese SDS-PAGE 12 % e os spots foram submetidos ao espectrômetro MALDI-TOF\TOF. Na análise genômica, foram selecionados reads da plataforma Illumina maiores que 100 nt, e maiores que 1000 nt no sistema PacBio. Ambos sistemas 292,3 milhões de reads, cobrindo o genoma haploide da espécie (1,25Gb). Analisando a cobertura dos mapeamentos entre os espécimes 0B e 6B, 44 contigs apresentaram diferenças maiores em seis vezes, sendo possíveis candidatos a sequências pertencentes aos cromossomos Bs. As proteínas anotadas foram identificadas como sendo principalmente, elementos de transposons e retrotransposons e as demais identificadas como proteínas de vias metabólicas, inclusive do sistema imune. Foi interpretado que os peixes com cromossomos B apresentam proteínas diferenciais, as quais poderão estar associadas ao aumento do desempenho dos animais portadores desses elementos genômicos. Na análise proteômica, foram identificadas 11 proteínas com diferença de abundância. O indivíduo 6B apresentou maior quantidade de proteínas com abundância aumentada comparada ao indivíduo 0B, como ocorreu com as proteínas: actina, miosina, proteínas de choque térmico, enolase e ATP sintase. Estas proteínas são classificadas por participarem de vias do metabolismo e de processos celulares e de sinalização. O que sugere a participação dos cromossomos Bs na up-regulação de proteínas nos indivíduos 6B aumentando a resposta metabólica. Embora os dados genômicos indiquem a existência de sequências potencialmente relevantes para a resposta imunológica dos espécimes, os dados proteômicos apontam para efeitos não desejáveis (sugeridos pelas altas taxas metabólicas dos espécimes sem cromossomos Bs e com seis cromossomos Bs). A associação das abordagens genômica e proteômica, junto ao padrão de classes modais no estoque e em populações naturais de P. lineatus sugerem que a presença de dois cromossomos Bs metacêntricos, a média observada na amostra, esteja associada ao melhor desempenho desses indivíduos. |