ISSN |
2237-9045 |
Instituição |
Universidade Federal de Viçosa |
Nível |
Pós-graduação |
Modalidade |
Pesquisa |
Área de conhecimento |
Ciências Agrárias |
Área temática |
Ciências Agrárias |
Setor |
Departamento de Fitotecnia |
Bolsa |
CAPES |
Conclusão de bolsa |
Não |
Apoio financeiro |
CAPES, CNPq, FAPEMIG, Outros |
Primeiro autor |
Danúbia Rodrigues Alves |
Orientador |
Eveline Teixeira Caixeta Moura |
Outros membros |
Dênia Pires de Almeida, Edson Mario de Andrade Silva, Isabel Samila Lima Castro, TIAGO ANTONIO DE OLIVEIRA MENDES |
Título |
Relação genética entre Híbrido de Timor CIFC 832/2 e genomas sequenciados de Coffea |
Resumo |
Cafeeiros do grupo Híbrido de Timor (HdT), resultante da hibridação natural entre Coffea arabica e Coffea canephora, têm sido extensivamente utilizados em programas de melhoramento de café por possuir genes de resistência a diversas raças de Hemileia vastatrix. Esse patógeno infecta a maioria das cultivares da espécie de café mais cultivada no mundo, C. arabica, acarretando grandes prejuízos econômicos a cafeicultura mundial. Dentre os cafeeiros desse grupo, CIFC 832/2 tem sido uma das principiais fontes de resistência utilizada, pois apresenta resistência durável e contém respostas mais rápidas de resistência a ferrugem. Além disso, esse HdT possui resistência a outras doenças e cruza facilmente com os cultivares de C. arabica, favorecendo a transferência dos seus genes de resistência. O objetivo do estudo foi avaliar a relação genética evolutiva de uma região do genoma do HdT CIFC 832/2 com três genomas de C. arabica, dois de C. eugenioides e dois de C. canephora. Foram realizados dois sequenciamentos de um clone BAC (Bacterial Artificial Chromosome), clone 70-22F HdT CIFC 832/2, contendo uma marca associada à resistência, usando Plataforma MiSeq (Illumina). Por meio das reads obtidas, foi feita montagem de novo e realizou-se uma busca de identidade genética entre os fragmentos do clone e genomas de Coffea, utilizando o software Tophat. Os contigs obtidos foram ordenados usando o software SPAdes e efetuou-se um alinhamento entre o genoma montado da BAC e os sete genomas. Realizou-se a predição gênica com base no reconhecimento de regiões previamente caracterizadas de Solanum lycopersicum em software AUGUSTUS. A anotação dos genes foi obtida a partir dos genomas de C. arabica, C. canephora e C. eugenioides, utilizando a ferramenta BLAST. Foram selecionadas cinco classes gênicas atuantes no metabolismo primário e efetuou-se uma análise evolutiva entre os genomas, baseada em alinhamentos múltiplos de sequências utilizando o software MEGA. As análises de identidade genética mostraram uma maior porcentagem de mapeamento entre o clone e dois genomas de C. arabica e dois de C. eugenioides. Em relação a C. canephora, os valores foram inferiores a 1%. Os resultados obtidos com o alinhamento entre os genomas também revelaram uma baixa associação de genes do HdT com genes dos genomas de C. canephora, mas uma alta associação com genes de um dos genomas de C. eugenioides e um dos genomas de C. arabica. A árvore filogenética mostrou uma relação evolutiva mais estreita entre genes do HdT e genes pertencentes ao genoma de C. eugenioides. Esse resultados sugerem que o HdT CIFC 832/2 tem relação genética mais próxima com a espécie C. eugenioides e uma relação mais distante com a espécie C. canephora. Essas informações auxiliam na compreensão de como ocorreu à evolução do HdT e a introgressão de genes de resistência, originando dados relevantes para o uso eficiente dos recursos disponíveis nos híbridos naturais em programas de melhoramento do cafeeiro. |
Palavras-chave |
Biotecnologia, Hemileia vastatrix, Melhoramento do cafeeiro |
Forma de apresentação..... |
Painel |