Ciência para a Redução das Desigualdades
15 a 20 de outubro de 2018
Trabalho 10677
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Ciências Biológicas |
| Setor | Departamento de Biologia Geral |
| Bolsa | FAPEMIG |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Apoio financeiro | FAPEMIG |
| Primeiro autor | Rafael Paulo da Silva |
| Orientador | MARCIANE DA SILVA OLIVEIRA |
| Outros membros | Alexandre Gomes Ferraz, COSME DAMIAO CRUZ, Vinícius Quintão Carneiro |
| Título | Organização da diversidade gerada pela deriva genética através dos Mapas auto-organizáveis de Kohonen. |
| Resumo | A deriva genética é um fenômeno de amostragem que leva a mudanças aleatórias que ocorrem em populações com o passar das gerações, tendo por consequência o aumento do número de homozigotos, e é mais pronunciada em populações de tamanho reduzido. Por ser a deriva genética um processo estocástico, não é possível prever a direção da mudança. Mas observa-se perda de variação genética e a fixação de alelos em diferentes loci, levando a diferenciação em subpopulações com alta uniformidade dentro. Os mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOM) são estruturas neurais competitivas, com aprendizado competitivo, que tem a capacidade de detectar similaridades, regularidades e correlações, agrupando em classes (clusters) as populações. Neste sentido, o presente trabalho teve como objetivo perceber a organização da diversidade gerada pela deriva genética com auxílio dos SOM. Para gerar o efeito de deriva sobre as populações, foi utilizado o processo de simulação do Portal Genes (Cruz, 2016). Inicialmente foi simulada uma população base com 1000 indivíduos, com um loco dialélico e p = 0,5. Dez amostras com dez indivíduos cada foram geradas a partir desta população base e submetidas a quatro gerações de acasalamento ao acaso. Das 40 populações geradas, foram estimadas as frequências alélicas (p e q) e as frequências genotípicas (D, H e R). Essas variáveis foram utilizadas como entradas de cada uma das populações. Este banco de dados foi analisado pelo portal Genes versão 2016 em integração com o MATLAB, versão R2012a, e foi empregada a metodologia de SOM com grade 10x10, topologia hextop e raio igual a 1, com 2000 épocas. A visualização do SOM mostrou a organização das populações de acordo com as gerações, onde os indivíduos amostrados da geração zero se apresentaram agrupados e próximos e com o passar das gerações os indivíduos se mostraram agrupados de maneira mais dispersa, tornando possível perceber o efeito das gerações de deriva genética nas populações observadas. Uma vez que, a amostragem continuada em populações leva à oscilação gênica. Esta por sua vez, leva à diferenciação em subpopulações com alta uniformidade dentro das populações e maior variabilidade genética entre as mesmas. Neste sentido, através dos Mapas auto-organizáveis de Kohonen foi possível perceber a organização da diversidade gerada pela deriva genética e como essa se amplia com as gerações. |
| Palavras-chave | Redes Neurais, Genética de Populações, Diversidade Genética |
| Forma de apresentação..... | Painel |