Resumo |
Dentre os fungos do gênero Colletotrichum, destaca-se Colletotrichum lindemuthianum, agente etiológico da antracnose do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), que é um intessante modelo de estudo, devido ao seu estilo de vida hemibiotrófico. Para o estabelecimento da doença, os fitopatógenos precisam driblar as defesas do hospedeiro, dentre elas os compostos antimicrobianos secretados com o intuito de barrar seu desenvolvimento, como, por exemplo, as fitoalexinas e as formas reativas de oxigênio. Dentre as estratégias empregadas para lidar com a presença destes compostos, destaca-se a resistência mediada por efluxo, que resulta da atividade de transportadores ABC, responsáveis pelo efluxo de compostos das células fúngicas. Transportadores ABC tipicamente contém além domínios de ligação ao nucleotídeo (NBD), segmentos transmembrana (TMD). O presente trabalho teve como objetivos: identificar genes que codificam transportadores ABC em cinco espécies de Colletotrichum e analisar comparativamente as sequências das proteínas, com ênfase em C. lindemuthianum. Para identificar os genes que codificam transportadores ABC nos genomas de C. fioriniae, C. gloesporioides, C. graminicola, C. higginsianum e C. lindemuthianum foi criado um banco de dados de sequências de transportadores ABC disponíveis no Uniprot. Contra este banco de dados foi realizado um BLASTp (cutt-of 10-5), utilizando o proteoma de cada espécie na consulta. Sequências apresentando identidade com transportadores ABC foram analisadas quanto à presença de domínios NBD e TMD, utilizando o CDD (NCBI). Consideraram-se transportadores ABC somente as sequências contendo ao menos uma cópia de cada domínio. Para a análise filogenética dos transportadores ABC de C. lindemuthianum foi utilizado software Geneious 9.0. O número de genes que codificam transportadores ABC variou para cada espécie avaliada, onde foram encontrados: 34 em C. lindemuthianum, 60 em C. higginsianum, 48 em C. graminicola, 64 em C. gloesporioides e 51 em C. fioriniae. Dentre os transportadores ABC identificados no genoma de C. lindemuthianum, 13 pertencem a família B, 5 a família C, 2 a família D, 2 a família F e 12 a família G. Colletotrichum lindemuthianum apresenta um pequeno número de genes codificando transportadores ABC quando comparado às espécies mais generalistas avaliadas neste trabalho. Interessantemente, C. lindemuthianum consiste num patógeno altamente especializado, infectando apenas uma espécie vegetal, enquanto outros, como C. gloesporioides, apresentam uma vasta gama de hospedeiros e grandes repertórios de transportadores ABC, indicando que estes, possivelmente, estão diretamente relacionados a esta gama de hospedeiros. A maioria dos transportadores ABC de C. lindemuthianum pertencem às famílias ABC-C e ABC-G, previamente reportadas como envolvidas na resistência mediada por efluxo, o que indica que, apesar deste repertório ser pequeno, provavelmente é crucial para o estabelecimento da infecção no feijoeiro. |