Do Lógico ao Abstrato: A Ciência no Cotidiano
23 a 28 de outubro de 2017
Trabalho 8112
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Microbiologia |
| Setor | Departamento de Biologia Geral |
| Bolsa | Outros |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Apoio financeiro | Outros |
| Primeiro autor | Clara Nogueira Laguardia |
| Orientador | SERGIO OLIVEIRA DE PAULA |
| Outros membros | Josicelli Souza Crispim, Larissa Cristina Araújo, Phedra Gusmão da Silva de Oliveira, Roberto Sousa Dias |
| Título | Caracterização de elementos profago-like similares de Desufovibrio alaskensis |
| Resumo | As Bactérias Redutoras de Sulfato (BRS) compõem um grupo importante de bactérias, sendo caracterizadas pela redução de sulfato e produção de sulfeto de hidrogênio (H2S). Além do gás H2S ser altamente tóxico, as BRS induzem a biocorrosão de metais, causando problemas para a indústria petrolífera. Por isso, há a necessidade de controlar suas populações e uma forma de controle é a utilização de bacteriófagos. Bacteriófagos são vírus que infectam bactérias, recebendo o nome de profagos aqueles que integram seu material genético no genoma da célula hospedeira. Entretanto, nenhum trabalho é encontrado sobre esses vírus em Desulfovibrio alaskensis, uma espécie do grupo de BRS isolada de ambiente de extração de petróleo. Assim, o objetivo deste trabalho é caracterizar dois de quatro elementos de D. alaskensis, previamente identificados pelo nosso grupo de pesquisa, para tentar entender a ligação desses elementos com a diversidade da célula hospedeira. Os elementos profago-like foram identificados pelo programa PHASTER a partir dos genomas de duas linhagens de D. alaskensis, G20 e DSM16109, obtidos do NCBI. Para a caracterização dos elementos foram utilizados os programas PSI-BLAST, para identificação de proteínas; BLASTn, para comparação das sequências dos elementos; e Mauve, para a análise comparativa. A D. alaskensis G20 possui dois elementos profago-like com aproximadamente 78% de identidade. Ambos os elementos foram classificados como completos e pertencentes à família Myoviridae, cobrindo, em conjunto, por volta de 2,4% do genoma bacteriano. Um dos elementos apresenta 41409 pb e 63,1% de conteúdo GC, enquanto o outro elemento apresenta 48688 pb e 60,7% de conteúdo GC. A análise comparativa entre esses dois elementos mostra que eles são colineares e estão localizados de forma invertida em fitas opostas do DNA. Além disso, um dos elementos possui uma inserção de genes bacterianos de 7kp, caracterizando o envolvimento desse elemento com a diversidade bacteriana. O segundo elemento, aquele que não possui essa inserção, possui 95,15% de similaridade com um elemento da linhagem DSM16109, demonstrando ser uma aquisição antiga da espécie. Esse grupo de elementos apresenta sequências que codificam integrase, peptidase, DNA metiltransferase, proteínas da cauda do fago, do capsídeo, do portal, lisozima e uma proteína de membrana bacteriana. Genes que codificam proteínas da fibra da cauda e replicação não foram identificados. Por outro lado, muitos genes hipotéticos estão presentes e podem estar relacionados com essas funções. Este estudo mostra que D. alaskensis G20 apresenta elementos muito similares, que estão envolvidos com a diversidade bacteriana. Estudos posteriores são necessários para verificar a expressão desses elementos e assim, estudar a possibilidade de utilização dos mesmos no controle de BRS. |
| Palavras-chave | Bactérias redutoras de sulfato, bacteriófagos, elementos profago-like. |
| Forma de apresentação..... | Painel |