Do Lógico ao Abstrato: A Ciência no Cotidiano
23 a 28 de outubro de 2017
Trabalho 7725
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Pós-graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Zootecnia |
| Setor | Departamento de Zootecnia |
| Bolsa | CNPq/Balcão |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Apoio financeiro | CAPES, CNPq, FAPEMIG |
| Primeiro autor | José Teodoro de Paiva |
| Orientador | PAULO SAVIO LOPES |
| Outros membros | FABYANO FONSECA E SILVA, Pedro Henrique Ferreira Freitas, SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARAES |
| Título | Eficiência dos modelos LALDA para seleção genômica |
| Resumo | Recentemente, as duas principais fontes de informações para estudos genéticos via marcadores moleculares (LA - linkage analysis e LDA - linkage disequilibrium analysis) foram combinadas (surgindo o termo “LALDA”) para fins de seleção genômica (SG) e apresentaram resultados satisfatórios, inclusive superando o modelo LDA (tradicional de SG) em termos de capacidade preditiva em diferentes aplicações a dados simulados e reais de bovinos leiteiro. Mediante a importância econômica da característica conversão alimentar (CA) e de seus componentes (consumo de ração-CR e ganho de peso diário-GPD) para a suinocultura moderna, uma vez que os custos com alimentação representam a maior parte do custo total de produção, a utilização da SG para tais características se justifica e deve ser motivo de pesquisas na área de melhoramento genético animal. Neste sentido, objetivou-se propor uma metodologia para implementação dos modelos LALDA para predição genômica utilizando softwares livres, bem como aplicar a referida proposta a dados reais de GPD, CR e CA de uma população F2 (Piau x Comercial) de suínos. A proposta foi implementada em dois passos distintos. No primeiro, identificou-se os efeitos significativos de QTL em posições específicas do genoma para as características GPD, CR e CA via ajuste de modelos que consideraram o efeito aleatório de QTL via matriz IBD genotípica. No segundo, estas matrizes calculadas nas posições em questão foram utilizadas para inserir o efeito aleatório genotípico de QTL adicionalmente aos feitos aleatórios de marcadores SNPs e poligênico aditivo (baseado em matriz de parentesco tradicional) nos modelos Bayesanos de predição genômica (Bayesian Ridge Regression - BRR, Bayes A - BA, Bayes B - BB, Bayes C – BC e Bayesian LASSO - BL). Foram realizadas análises de qualidade de ajuste e de capacidade preditiva a fim de comprovar a eficiência dos modelos propostos. Em síntese, o modelo LALDA via BA mostrou a melhor qualidade de ajuste via DIC (Deviance Information Criterion) e maior capacidade preditiva quando comparado com os demais modelos LALDA (BRR, BB, BC e BL) para todas características estudadas. Embora de forma discreta, esta superioridade também se verificou ao comparar o modelo em questão com modelos alternativos que não contemplaram o efeito aleatório de QTL (modelos LDA tradicionais de SG), ou seja, o modelo LALDA proposto mostrou-se eficiente e plausível de ser implementado por meio de softwares livres. |
| Palavras-chave | análise de ligação, QTL, matriz IBD genotípica |
| Forma de apresentação..... | Painel |