ISSN |
2237-9045 |
Instituição |
Universidade Federal de Viçosa |
Nível |
Pós-graduação |
Modalidade |
Pesquisa |
Área de conhecimento |
Ciências Biológicas e da Saúde |
Área temática |
Microbiologia |
Setor |
Departamento de Microbiologia |
Bolsa |
CNPq |
Conclusão de bolsa |
Não |
Apoio financeiro |
CAPES, CNPq, FAPEMIG |
Primeiro autor |
Isabelle Gonçalves de Oliveira Prado |
Orientador |
DENISE MARA SOARES BAZZOLLI |
Outros membros |
MATEUS FERREIRA SANTANA, Monalessa Fábia Pereira, MOYSES NASCIMENTO, Pedro Marcus Pereira Vidigal |
Título |
Análise e caracterização in silico do proteoma referência de Actinobacillus pleuropneumoniae sorotipo 8. |
Resumo |
Actinobacillus pleuropneumoniae é o agente etiológico da pleuropneumonia suína, uma doença respiratória que resulta em significantes perdas econômicas no setor da suinocultura. O patógeno é classificado em 15 sorotipos que podem causar a doença com padrões diferentes de virulência entre eles. Em estudo sobre a caracterização dos isolados clínicos provenientes do Estado de Minas Gerais observou-se uma maior distribuição do sorotipo 8 nas fazendas investigadas e esses isolados apresentaram padrões de virulência distintos em experimentos utilizando um hospedeiro alternativo de infecção. Devido ao baixo número de genomas da espécie sequenciados, existem poucas informações acerca da sua variabilidade genética. Com o sequenciamento de seis isolados de A. pleuropneumoniae sorotipo 8 propomos um modelo de proteoma referência desse sorotipo para a realização de análises e a caracterização funcional. A montagem do proteoma referência foi realizada utilizando o programa Cd-hit com parâmetro de 0,85 de identidade entre as sequências. Obtivemos a partir dessa análise um total de 2186 proteínas. A partir da montagem do proteoma referência de A. pleuropneumoniae sorotipo 8 foi possível analisar as semelhanças compartilhadas com os demais sorotipos já descritos e caracterizar a parte diferencial. A anotação e caracterização funcional do proteoma referência foi baseada e contrastada utilizando cinco bancos de dados. Diante das análises de genômica comparativa realizadas entre o proteoma referência sorotipo 8 de A. pleuropneumoniae e os demais sorotipos, observamos um padrão de conservação entre esses. Muitas das proteínas do proteoma referência do sorotipo 8 que apresentaram baixa identidade com os demais sorotipos foram caracterizadas como proteínas hipotéticas, o que pode ser explicado pela escassez de estudos evidenciando as diferenças genômicas comparativas entre os sorotipos e, assim, muitas dessas proteínas não foram devidamente estudadas. A partir das análises de genômica comparativa e caracterização funcional será possível investigar a contribuição destas diferenças para a virulência dos isolados bacterianos estudados e promover o desenvolvimento de terapias e vacinas recém direcionadas utilizando proteínas alvo específicas identificadas através das análise de bioinformática. |
Palavras-chave |
Actinobacillus pleuropneumoniae, proteoma, genômica comparativa |
Forma de apresentação..... |
Painel |