Resumo |
O sistema CRISPR-Cas (Clustered Regularly Interespaced Short Palindromic Repeats associated to Cas proteins) é considerado um sistema imune adaptativo em procariotos e está presente em aproximadamente 40 e 90% das espécies conhecidas de bactérias e arqueas, respectivamente. O sistema CRISPR-Cas está organizado em loci constituídos por um operon que codifica as proteínas Cas e o locus CRISPR propriamente dito, que está organizado como sequências repetidas espaçadas por sequências provenientes de elementos genéticos móveis (bacteriófagos, plasmídeos e transposons). A imunidade é adquirida pela integração de fragmentos do DNA exógeno ao locus CRISPR seguida de transcrição e processamento deste, gerando pequenos RNAs CRISPR que guiam as proteínas Cas e resultam na degradação do material genético invasor. O sistema CRISPR-Cas pode ser usado pelo procarioto para controle endógeno da expressão gênica. Além disso, esse sistema pode ser geneticamente manipulado com a finalidade de marcar e degradar genes específicos em outros organismos. Em Actinobacillus pleuropneumoniae, um importante patógeno respiratório de suínos, ainda não foi relatada a existência e funcionalidade deste sistema. Assim, este trabalho teve por objetivo identificar e caracterizar o sistema CRISPR-Cas nessa espécie bacteriana. A presença de CRISPR-Cas em A. pleuropneumoniae foi investigada em 17 genomas sequenciados e depositados no banco de dados GenBank (NCBI), Destes genomas, seis sequências pertencem ao sorotipo 8 e foram isolados no Estado de Minas Gerais. As demais sequências depositadas são provenientes dos sorotipos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 9, 10, 11 e 13. As sequências genômicas foram analisadas pelo CRISPR Finder, cuja função é encontrar loci CRISPR e proteínas Cas associadas em sequências submetidas. O sistema CRISPR-Cas encontrado nos genomas analisados apresentaram a sequência de pares de bases compondo as repetições diretas, bem como a organização das proteínas Cas a ele associadas bastante conservadas, o que nos permite inferir que o sistema CRISPR-Cas de A. pleuropneumoniae sofreu poucas mudanças durante a história evolutiva desta espécie. Essa característica sugere que há uma grande probabilidade de que o sistema CRISPR-Cas de A. pleuropneumoniae seja ativo, perspectiva esta que avaliaremos como estratégia futura. |