Conexão de Saberes e Mundialização
19 a 24 de outubro de 2015
Trabalho 3676
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Pós-graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Agrárias |
| Área temática | Genética e melhoramento animal |
| Setor | Departamento de Zootecnia |
| Bolsa | CNPq |
| Conclusão de bolsa | Sim |
| Apoio financeiro | CAPES, CNPq |
| Primeiro autor | Evelyze Pinheiro dos Reis |
| Orientador | SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARAES |
| Outros membros | Débora Martins Paixão, Elcer Albenis Zamora Jerez, WALMIR DA SILVA |
| Título | Ontologias gênicas e vias metabólicas identificadas in silico de genes diferencialmente expressos entre duas raças de suínos durante a miogênese |
| Resumo | A massa do músculo é influenciada pelo número e tamanho de seu principal constituinte: as fibras musculares. A formação deste tecido (miogênese) ocorre durante o período pré-natal. Assim, este trabalho foi conduzido para avaliar a expressão de miogenes por RNAseq, para se entender as características moleculares responsáveis por diferentes musculosidades entre suínos. Para isso, três porcas grávidas de suínos Piau e comercial (tipo Landrace e Large-White) foram submetidas à cesariana nas idades pré-natais. O embrião inteiro foi coletado aos 21 dias de gestação (dpc) e o músculo Longissimus dorsi foi amostrado dos fetos aos 40, 70 e 90 dpc. O RNA foi sequenciado na plataforma SOLiD™. As reads foram mapeadas no transcriptoma referência por meio do Bowtie. A análise da expressão diferencial foi realizada por meio do pacote DEGseq (R/Bioconductor). As ontologias gênicas (GOs) foram obtidas no ToppCluster. Os termos de GOs relacionados à miogênese foram identificados juntamente com os miogenes. Estes foram submetidos à análise de vias metabólicas no DAVID. No total, foram identificados 23 termos de GOs relacionadas à miogênese. Aos 21 dpc, 228 miogenes foram mais expressos em suínos Piau que em comercial. Os termos de GOs identificados foram: complexo miosina II, complexo miosina muscular, constituinte estrutural do músculo, desenvolvimento do embrião, desenvolvimento do embrião de Cordados, desenvolvimento do órgão, desenvolvimento do órgão muscular, fibra contráctil, finalização do desenvolvimento do embrião ao nascimento, ligação à miosina II, miofibrila, morfogênese do órgão, morfogênese do tecido, parte da fibra contráctil e sarcômero. As vias metabólicas identificadas aos 21 dpc foram adesão focal, interação receptor-ECM, vias de sinalização HEDGEHOG e WNT, regulação do citoesqueleto de actina. Aos 40 dpc, 90 miogenes foram mais expressos em suínos comercial que em Piau. Os termos de GOs identificados foram: banda I,contração do músculo esquelético, desenvolvimento da estrutura muscular, desenvolvimento do órgão muscular, fibra contráctil, miofibrila, movimento do músculo esquelético, parte da fibra contráctil, processo do sistema muscular, regulação da contração do músculo esquelético, sarcômero e sarcoplasma. Aos 40 dias, foram identificadas as vias de sinalização do cálcio, MAPK e regulação do citoesqueleto de actina. Aos 70 dpc, 23 miogenes foram mais expressos em suínos comercial que em Piau. Os termos de GOs identificadas foram: de fibra muscular, Banda I, Disco Z, parte da fibra contráctil, miofibrila e sarcômero. Aos 70 dias, a via de sinalização do cálcio foi identificada. E aos 90 dpc, não há miogenes e, portanto, nenhuma via metabólica. Assim, os genes diferencialmente expressos (DEGs) agrupados nos termos de GOs relacionados à miogênese e presentes nas vias metabólicas identificadas são mais expressos em Piau do que em comercial aos 21 dpc. Aos 40 e 70 dpc os DEGs são mais expressos em comercial do que em Piau. |
| Palavras-chave | expressão gênica, miogênese, RNAseq |
| Forma de apresentação..... | Painel |