Resumo |
A Soja (Glycine max (L.) Merrill) é a cultura agrícola que mais cresceu nas ultimas décadas e corresponde a 49% da área de cultivo de grãos do país. É componente importante na fabricação de rações, alimentação humana e na produção de biodiesel, por conter altos teores de proteína e óleo. O óleo de soja é composto por triacilgliceróis que são constituídos de três cadeias de ácidos graxos esterificados por um glicerol. Os principais são: ácido palmítico (16:0) 13%; ácido esteárico (18:0) 4%; ácido oleico (18:1 Δ9) 18%; ácido linoleico (18:2 Δ9,12) 55% e ácido linolênico (18:3 Δ9,12,15) 10%. O aumento da quantidade de Ac. Oleico e redução de Ac. Linolênico é um dos focos atuais do Programa de Melhoramento da Qualidade da Soja. A conversão de ácido oleico em ácido linoleico se da através da ação da enzima ω-6-dessaturase, codificada pelos genes FAD2. O gene FAD2-1B, vem sendo utilizado para produzir materiais com alto índice de oleico através do melhoramento convencional. O objetivo deste trabalho foi a caracterização do gene FAD2-1B de uma linhagem de soja com alto teor de ácido oleico. A sequência do gene foi obtida a partir do banco de dados PHYTOZOME, onde se encontra o genoma da soja. Foram desenhados quatro conjuntos de primers para a amplificação da região de interesse do gene, usando o programa “Primer3 Input Program”, com os seguintes parâmetros: i) amplicon variando de 600 a 1000 pb; ii) primer com 19 a 25 pb; iii) temperatura de anelamento ™ entre 54 e 64 ºC; e iv) conteúdo de CG% entre 40 e 60%. A qualidade e especificidade dos primers foi verificada com as ferramentas Primer Select 3.1, iPCR e pelo banco de dados PHYTOZOME. Foram realizadas reações de amplificação dos fragmentos por PCR, a partir de DNA extraído de folhas, e os produtos das reações submetidos à eletroforese em gel de agarose 2%. Foram testadas diferentes Tms para conseguir uma única banda. As sequências dos fragmentos amplificados foram editadas usando os programas SEQUENCER 4.1.4 e CodonCode Aligner e alinhadas pelo ClustalW para identificação dos polimorfismos. A maior parte das regiões do gene foi seqüenciada com um valor de Phred igual ou superior a 30, que indica boa qualidade do sequenciamento. Os polimorfismos obtidos do sequenciamento foram submetidos à tradução da plataforma ExPASy e a sequência de aminoácidos obtidos do gene FAD2-1B da PI 283327 foi alinhada com a sequência referente à Williams 82 pelo ClustalW. O gene FAD2-1B contém no total 3593 pb (3 íntrons, 3 éxons, mais regiões regulatórias 3’UTR e 5’UTR). Em outros trabalhos já foi relatado que existem duas mutações no FAD2-1B do progenitor PI 283327. O alinhamento demonstrou a troca de uma citosina por uma guanina, levando à troca de uma arginina por uma prolina. Esta troca pode levar à mudança estrutural na proteína, uma vez que os dois aminoácidos têm propriedades químicas diferentes. As próximas etapas do trabalho visam a construção de marcadores moleculares para Seleção Assistida. |