ISSN |
2237-9045 |
Instituição |
Universidade Federal de Viçosa |
Nível |
Graduação |
Modalidade |
Pesquisa |
Área de conhecimento |
Ciências Agrárias |
Área temática |
Genética e melhoramento vegetal |
Setor |
Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular |
Bolsa |
PIBIC/CNPq |
Conclusão de bolsa |
Não |
Apoio financeiro |
CNPq |
Primeiro autor |
Isabela Delpupo Caliman |
Orientador |
LUIZ ORLANDO DE OLIVEIRA |
Outros membros |
Ana Paula Gomes Soares, Camila Araujo dos Santos, Leandro Luiz Borges, Petiara Santos Reis |
Título |
Montagem de bancos de dados de sequências de DNA para estudos de história evolutiva de Cercospora associada a mancha púrpura em soja |
Resumo |
O gênero Cercospora contém inúmeros fungos fitopatogênicos importantes de variada gama de hospedeiros. Dentre as espécies de Cercospora destaca-se a Cercospora kikuchii, fungo associado a três doenças da soja: crestamento foliar, mancha púrpura nos grãos e mortalidade de plântulas. As perdas causadas por estas doenças podem chegar a 20% dependendo das condições climáticas. Sua variabilidade genética é muito pouco conhecida, o que dificulta a implementação de estratégias de controle por meio de resistência genética. O objetivo deste trabalho foi investigar a história evolutiva do fungo por meio de análises de sequências de genes (nucleares e mitocondriais). De cada isolado fúngico foi extraído DNA genômico e foram amplificadas por PCR com iniciadores específicos a região do espaçador interno transcrito (ITS) 560 pares de bases (pb), Cercosporin Facilitator Protein (CFP) 935 pb, Citocromo b (CYTB) 700 pb, β-tubulina 630 pb, Histona (CYLH3) 353 pb, Actina (ACT) 560 pb, Calmodulina (CAL) 500 pb e Translation Elongation Factor-1α (TEF) 1.284 pb. A temperatura ótima de anelamento dos primers foi determinada e as amplificações feitas por PCR foram otimizadas pela alteração da concentração dos reagentes bem como pela adição de coadjuvantes. Para alguns genes, novos conjuntos de primers foram desenhados para a amplificação de indivíduos cujo sítio de anelamento era diferente dos demais. Para isolados argentinos e brasileiros sequenciou-se o gene CFP para 140 amostras; CYTB para 98 amostras; ITS para 71 amostras; β-tubulina para 240 amostras; ACT para 33 amostras; CAL para 24 amostras; CYLH3 para 38 amostras; TEF para 28 amostras. As sequências obtidas para cada gene foram editadas e alinhadas. Os dados moleculares obtidos serão utilizados em estudos filogeográficos e filogenéticos visando entender a história evolutiva desse patógeno. O conhecimento da atual diversidade genética de C. kikuchii pode ser aplicada na otimização de estratégias de controle do patógeno pelo melhoramento genético, diminuindo os riscos desta ameaça às lavouras de soja brasileiras. |
Palavras-chave |
Cercospora, filogeografia, diversidade genética |
Forma de apresentação..... |
Painel |