Ciência e Tecnologia: bases para o Desenvolvimento Social

20 a 25 de outubro de 2014

Trabalho 2657

ISSN 2237-9045
Instituição Universidade Federal de Viçosa
Nível Pós-graduação
Modalidade Pesquisa
Área de conhecimento Ciências Agrárias
Área temática Genética e melhoramento animal
Setor Departamento de Zootecnia
Bolsa FAPEMIG
Conclusão de bolsa Não
Apoio financeiro CAPES, FAPEMIG
Primeiro autor Renata Veroneze
Orientador PAULO SAVIO LOPES
Outros membros FABYANO FONSECA E SILVA, Marcos Soares Lopes, SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARAES
Título Seleção genômica para espessura de toucinho em linhas macho de suínos
Resumo A seleção genômica é uma metodologia que utilliza marcadores de DNA espalhados por todo o genoma para a predição de valores genéticos (VG) de candidatos a seleção, sendo conhecida por possibilitar a obtenção de VG mais acurados para indivíduos jovens e reduzir o intervalo de geração. Os programas de melhoramento de suínos têm buscado adaptar-se para o uso dessa nova técnica, sendo de fundamental importância para tal objetivo, o conhecimento das acurácias esperadas. O objetivo com o presente trabalho foi avaliar a acurácia da seleção genômica para espessura de toucinho (ET) em linhas macho de suínos. Os dados utilizados nesse estudo consistem em animais fenotipados e genotipados de 3 linhas macho (SL1, n=1146; SL2, n=682; SL3, n=1264). Os animais foram genotipados com o Porcine SNP60 Beadchip, o qual possui aproximadamente 64.000 marcadores SNP. Marcadores no cromossomo X, com frequência do alelo menor (MAF) <0,01, call rate <95% e desvio do Equilibrio de Hardy-Weinberg (p-value<10-7) foram excluídos da análise, restando em média 44.029 marcadores. A característica avaliada foi espessura de toucinho, a qual foi previamente corrigida para os efeitos fixos de sexo e rebanho-ano-estação e para covariável peso. Os animais foram distribuídos de forma aleatória em populações de treinamento e validação e a predição foi repetida 20 vezes com diferentes amostras, sendo a população de treinamento sempre composta por 600 animais. O método GBLUP foi utilizado para a predição dos valores genéticos e a acurácia foi calculada pela correlação entre os valores genéticos genômicos e o fenótipo corrigido. A acurácia da predição variou de acordo com a população avaliada, sendo 0,63, 0,31 e 0,41 para as linhas SL1, SL2 e SL3, respectivamente. A avaliação da distribuição do parentesco genômico das três populações estudadas revelam que SL2 possui maior proporção de animais (12%) com parentesco entre 0,0625 - 0,25 em relação as linhas SL1 e SL3, as quais possuem valores similares (8 e 9%, respectivamente). O desequilibrio de ligação (LD) das linhas revela que SL2 possui maior LD em comparação com as linhas SL1 e SL3. Sendo assim, o parentesco e o LD não suportam os resultados encontrados, uma vez que com base nesses fatores seria esperado maior acurácia na SL2. As herdabilidades da característica foram de 0,67, 0,32 e 0,43 para as linhas SL1, SL2 e SL3, respectivamente. Esses dados, mostram claramente que quanto maior a herdabilidade da característica na população maior a acurácia dos VGs, parecendo ser esse o principal fator de influência nas acurácias das populações avaliadas. As acurácias obtidas mostram o potencial da seleção genômica para espessura de toucinho e mostram o grande impacto da herdabilidade na acurácia da predição.
Palavras-chave SNP, acurácia, valor genético
Forma de apresentação..... Painel
Gerado em 0,65 segundos.