Bioeconomia: Diversidade e Riqueza para o Desenvolvimento Sustentável
21 a 25 de outubro de 2019
Trabalho 12906
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Ciências Biológicas |
| Setor | Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Primeiro autor | Alexia Suellen Fernandes |
| Orientador | NEWTON MORENO SANCHES |
| Outros membros | Amanda Souto de Souza Almeida, Bruna Milena da Silva |
| Título | Predição in silico de mRNAs alvos para um pequeno RNA de Haemophilus ducleyi |
| Resumo | Haemophilus ducreyi (H. ducreyi) é uma bactéria patogênica Gram-negativa, pertencente à família Pasteurellaceae responsável por causar úlceras genitais nomeadas como cancróide. O cancróide é uma doença sexualmente transmissível com maior incidência entre os homens. Em mulheres as lesões ocorrem na vulva ou no colo do útero. Patógenos em geral usam diversos mecanismos de virulência durante o processo de infecção do hospedeiro e esses mecanismos podem ter diversas vias de regulação, como por exemplo a expressão de sRNAs (small RNAs) que atuam em mRNAs alvos interferindo na atividade de tradução e/ou transcrição. Recentemente, nosso grupo identificou através de análises in silico o primeiro candidato a sRNA (nomeado de ALE01) no genoma da bactéria Haemophilus ducreyi. O objetivo deste trabalho foi caracterizar este sRNA e predizer através de ferramentas in silico os alvos que ele pode estar envolvido. As análises foram realizadas a partir de genomas depositados no banco de dados NCBI. A pipeline desenvolvida para as análises incluiram os softwares RNAfold (estrutura do sRNA); GLASSgo (pesquisa de homólogos); MAFFT (alinhamento) das sequências de sRNAs), JALVIEW (identidade das sequências); CopraRNA (predição dos alvos); Banco de dados Keeg (anotação funcional dos alvos) e STRING (rede de interação entre os alvos preditos). Foram obtidos 67 possíveis alvos, dos quais oito (napA, napB, napG, napF, cydA, rplN, rplF e rplI) foram selecionados com base na força de interação mRNA-Ale01 e conservação da estrutura secundária, envolvida no pareamento, predita para Ale01. Nossos resultados fornecem evidências da ação de Ale01 em mecanismos de regulação em situações de limitação de oxigênio e escassez de nutrientes. No primeiro, aumentando a expressão de fatores para montagem do complexo Nap e da expressão do gene cydA a fim de manter o funcionamento da cadeia transportadora de elétrons em condições de hipóxia. Já na segunda situação, Ale01 atua de modo inverso, interferindo nas funções dos genes da família rpl, bloqueando a tradução, quando não há nutrientes disponíveis no meio, e assim diminuindo a expressão de proteínas não necessárias para situações de estresse. Deste modo, conclui-se que Ale01 é um candidato para atuar na adaptação de H. ducreyi durante condições de estresse e assim auxiliar na virulência desta bactéria. |
| Palavras-chave | sRNAs, virulência, Haemophilus ducreyi |
| Forma de apresentação..... | Painel |