Bioeconomia: Diversidade e Riqueza para o Desenvolvimento Sustentável
21 a 25 de outubro de 2019
Trabalho 12886
| ISSN | 2237-9045 |
|---|---|
| Instituição | Universidade Federal de Viçosa |
| Nível | Graduação |
| Modalidade | Pesquisa |
| Área de conhecimento | Ciências Biológicas e da Saúde |
| Área temática | Ciências Biológicas |
| Setor | Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde |
| Conclusão de bolsa | Não |
| Primeiro autor | Bruna Milena da Silva |
| Orientador | NEWTON MORENO SANCHES |
| Outros membros | Alexia Suellen Fernandes, Amanda Souto de Souza Almeida, HELDER CANTO RESENDE |
| Título | Filogenia do RNA não codificante ALE01 na Bactéria Haemophilus ducreyi (Pasteurellaceae) |
| Resumo | Haemophilus ducreyi (Pasteurellaceae) é uma bactéria Gram negativa, anaeróbica facultativa, responsável pela doença cancroide, que se manifesta por meio de pápulas eritematosas dolorosas com maior incidência em indivíduos do sexo masculino. H. ducreyi apresenta elevada virulência a qual é determinada por diversos fatores. Basicamente, a regulação da virulência frente aos estímulos ambientais pode ser realizada tanto por proteínas quanto por RNAs reguladores (sRNAs), sendo os últimos mais rápidos na capacidade de resposta da bactéria ao estímulo ambiental. Em geral os sRNAs regulam a expressão gênica atuando na estabilidade, transcrição ou tradução do mRNA e afetando assim os circuitos de equilíbrio que permitem a sobrevivência de bactérias no hospedeiro. Nas últimas décadas o conhecimento sobre a ação dos sRNAs tem modificado a compreensão sobre os mecanismos de regulação de expressão gênica. No gênero Haemophilus já foram identificados diversos sRNAs em 15 espécies distintas. Na espécie Haemophilus ducreyi nosso grupo identificou recentemente, através de análises in silico, uma provável sequência codificadora para sRNA, a qual foi denominada como ALE01. O objetivo deste trabalho foi estudar a filogenia de ALE01 no domínio Bacteria e inferir sobre o mecanismo de transferência gênica de ALE01. As análises foram realizadas a partir do genoma da bactéria H. ducreyi, depositados no banco de dados NCBI. Foi realizada a pesquisa de sRNAs homólogos a ALE01 através do software GLASSgo, seguido de alinhamento das sequências de DNA com o software MAFFT e identificação das regiões conservadas pelo editor de alinhamentos JALVIEW. A seguir, foi realizada análise manual de sintenia das sequências identificadas em cada homólogo com base nos genomas depositados no banco de dados NCBI. As arvores filogenéticas foram reconstruídas por inferência Bayesiana utilizando o software MrBayes 3.2, com rodadas de 10 milhões de gerações para cada uma das oito cadeias markovianas independentes e eliminando 25% das gerações iniciais. Os modelos evolutivos de substituição foram estimados com auxílio do script MrModeltest2. Utilizou-se o programa FigTree v1.3.1 para a visualização das árvores filogenéticas. Nossos resultados indicaram a presença de homólogos para ALE01 distribuídos em 10 espécies de bactérias da família Pasteurellaceae e um padrão de distribuição filogenética da sequência de sRNAs entre os homólogos que indicam um provável mecanismo de transferência horizontal de genes para a região codificadora do sRNA ALE01. |
| Palavras-chave | Filogenia, sRNA, Haemophilus ducreyi |
| Forma de apresentação..... | Painel |